More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7383 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  100 
 
 
396 aa  768    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  61.94 
 
 
401 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  57.72 
 
 
398 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  57.18 
 
 
407 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  50.64 
 
 
393 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  55.18 
 
 
402 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  58.25 
 
 
413 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  55.58 
 
 
406 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  55.33 
 
 
402 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  48.48 
 
 
389 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  48.48 
 
 
389 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  55.58 
 
 
408 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  49.47 
 
 
395 aa  332  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  47.06 
 
 
404 aa  328  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  48.42 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  46.8 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  47.27 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  49.58 
 
 
398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  48.16 
 
 
405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  48.16 
 
 
405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  47.89 
 
 
398 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  47.97 
 
 
405 aa  322  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  46.27 
 
 
404 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  46.21 
 
 
400 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  46.21 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  46.21 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 
447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  48.62 
 
 
401 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  45.56 
 
 
388 aa  286  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  38.36 
 
 
406 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  38.36 
 
 
406 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  38.36 
 
 
403 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  45.14 
 
 
405 aa  259  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  42.57 
 
 
416 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  45.52 
 
 
399 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  45.27 
 
 
399 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  43.38 
 
 
400 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  45.57 
 
 
399 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  37.47 
 
 
392 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  47.55 
 
 
402 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  45.08 
 
 
399 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  50.26 
 
 
409 aa  243  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  37.99 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  37.99 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  39.2 
 
 
411 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  38.9 
 
 
399 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  37.6 
 
 
385 aa  232  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  42.7 
 
 
422 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  39.68 
 
 
415 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  37.73 
 
 
399 aa  226  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  45.77 
 
 
427 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.11 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.11 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.11 
 
 
399 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  45.58 
 
 
427 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  45.58 
 
 
427 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  45.58 
 
 
427 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000378785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 
415 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  42.12 
 
 
433 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  44.25 
 
 
431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  38.02 
 
 
405 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  39.83 
 
 
389 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  43.78 
 
 
419 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  33.76 
 
 
403 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  35.99 
 
 
395 aa  209  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  37.94 
 
 
394 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  35.46 
 
 
426 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  37.4 
 
 
391 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  39.84 
 
 
403 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  36.17 
 
 
383 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  37.65 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  34.96 
 
 
401 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  43.19 
 
 
419 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  37.18 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  33.88 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 
394 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  41.1 
 
 
403 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 
391 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  38.98 
 
 
421 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  36.06 
 
 
405 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  37.4 
 
 
394 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  36.06 
 
 
399 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  37.4 
 
 
394 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  36.06 
 
 
399 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  36.86 
 
 
394 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  37.4 
 
 
394 aa  195  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  38.66 
 
 
400 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  37.4 
 
 
394 aa  195  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0236  major facilitator transporter  45.31 
 
 
423 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00013187  hitchhiker  0.000000000803869 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  36.06 
 
 
399 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  36.06 
 
 
399 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  36.06 
 
 
399 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  36.06 
 
 
399 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 
413 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  37.94 
 
 
413 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  39.06 
 
 
410 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
413 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0228  major facilitator transporter  45.31 
 
 
425 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000132249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>