More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2790 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  100 
 
 		 406 aa  787    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  69.08 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  69.83 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  57.61 
 
 		 398 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  59.11 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  56.45 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  51.49 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  52.06 
 
 		 389 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  52.06 
 
 		 389 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  58.76 
 
 		 413 aa  339  5e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  49.74 
 
 		 398 aa  338  7e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  58.38 
 
 		 408 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 398 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  47.28 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  46.45 
 
 		 405 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 395 aa  318  9e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  46.55 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 		 447 aa  294  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  49.37 
 
 		 401 aa  292  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  46.77 
 
 		 400 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  46.77 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  46.77 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 		 388 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 405 aa  266  5e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  44.95 
 
 		 400 aa  262  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  38.02 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  38.02 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 399 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  47.93 
 
 		 399 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  38.02 
 
 		 403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  46.08 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  38.02 
 
 		 392 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  45.15 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 385 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 416 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 399 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 399 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  50.68 
 
 		 402 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  45.04 
 
 		 422 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  48.51 
 
 		 409 aa  235  9e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 		 415 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  46.55 
 
 		 431 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  41.24 
 
 		 397 aa  226  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 427 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  41.14 
 
 		 404 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  42.61 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 403 aa  217  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  38.44 
 
 		 411 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  40.63 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 427 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 413 aa  212  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000378785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  37.5 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 400 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  37.24 
 
 		 394 aa  209  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  37.24 
 
 		 394 aa  209  9e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 394 aa  209  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3860  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 442 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320217  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0028  MFS permease  43.54 
 
 		 422 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000623855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3799  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 433 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000291886  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  37.21 
 
 		 394 aa  206  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  36.46 
 
 		 394 aa  205  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  39.31 
 
 		 399 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  39.31 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  39.31 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  39.31 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  39.31 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  39.31 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  39.31 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  41.1 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 		 407 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 399 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  37.73 
 
 		 394 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  42.57 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 410 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  37.56 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  37.56 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  42 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>