More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1187 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  100 
 
 
421 aa  801    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  68.94 
 
 
411 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  47.76 
 
 
399 aa  334  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  47.76 
 
 
399 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  47.76 
 
 
399 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  47.63 
 
 
394 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  47.63 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  47.63 
 
 
394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  47.63 
 
 
394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  47.63 
 
 
394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  47.63 
 
 
394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 
406 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  47.18 
 
 
406 aa  302  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  47.27 
 
 
394 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  46.91 
 
 
394 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  47.01 
 
 
394 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  47.37 
 
 
394 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  47.37 
 
 
394 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  47.37 
 
 
394 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  46.53 
 
 
399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  50.14 
 
 
413 aa  278  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  45.96 
 
 
399 aa  276  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3576  major facilitator superfamily MFS_1  53.05 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.0569566 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 
399 aa  270  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  35.47 
 
 
394 aa  250  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  39.9 
 
 
399 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  40.61 
 
 
399 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  39.64 
 
 
399 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  47.91 
 
 
329 aa  247  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  43.24 
 
 
416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  38.85 
 
 
426 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  40.67 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  41.21 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  40.15 
 
 
399 aa  242  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  46.68 
 
 
395 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  39.75 
 
 
407 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  44.9 
 
 
423 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  47.66 
 
 
397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 
387 aa  233  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  38.9 
 
 
383 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  40.67 
 
 
390 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  40.65 
 
 
401 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  40.45 
 
 
401 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  41.67 
 
 
415 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3862  major facilitator transporter  47.24 
 
 
395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  40.8 
 
 
401 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.63 
 
 
403 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  41.75 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02501  hypothetical protein  47.22 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  39.75 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  38.08 
 
 
398 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1850  major facilitator superfamily MFS_1  47.96 
 
 
395 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  41.64 
 
 
401 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 
410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  41.64 
 
 
415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  41.34 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  39.01 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  40.82 
 
 
405 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  40.82 
 
 
399 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  37.89 
 
 
398 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  33.82 
 
 
415 aa  213  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  40.82 
 
 
399 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  40.82 
 
 
399 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  40.82 
 
 
399 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  40.82 
 
 
399 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  40.82 
 
 
399 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
404 aa  212  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  37 
 
 
405 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  37.15 
 
 
405 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  38.66 
 
 
396 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  37.84 
 
 
407 aa  209  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  42.82 
 
 
399 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  36.82 
 
 
405 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  43.05 
 
 
391 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  37.57 
 
 
405 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  37.57 
 
 
405 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  37.57 
 
 
405 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  36.52 
 
 
410 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  39.17 
 
 
400 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3309  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 
418 aa  203  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  38.24 
 
 
398 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 
413 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  36.21 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  39.95 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  36.21 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  34.22 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  39.95 
 
 
429 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 
397 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  40.47 
 
 
398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  40.47 
 
 
398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  40.47 
 
 
398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  40.47 
 
 
398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  40.73 
 
 
398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  40.73 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  37.73 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  37.6 
 
 
395 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>