More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4031 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4031  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  727    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46800  hypothetical protein  90.59 
 
 		 403 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280439  hitchhiker  0.0000006863 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  62.37 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  58.66 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  63.02 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  58.57 
 
 		 409 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  59.25 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  62.76 
 
 		 411 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  58.66 
 
 		 411 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  58.91 
 
 		 411 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  58.91 
 
 		 411 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  61.77 
 
 		 403 aa  361  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  59.64 
 
 		 411 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  49.61 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2541  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 443 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2442  major facilitator family transporter  60 
 
 		 406 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2398  major facilitator family transporter  59.5 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  52.23 
 
 		 410 aa  328  8e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  51.56 
 
 		 416 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  54.24 
 
 		 404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0938  major facilitator superfamily MFS_1  57.95 
 
 		 352 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125076 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  50.65 
 
 		 414 aa  305  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  48.99 
 
 		 401 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  49.24 
 
 		 401 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  48.99 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  47.74 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  46.61 
 
 		 402 aa  289  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  53.42 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  45.01 
 
 		 399 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  45.01 
 
 		 399 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  50.91 
 
 		 408 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  45.01 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  48.97 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  45.45 
 
 		 394 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  45.45 
 
 		 394 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 394 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  45.45 
 
 		 394 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  45.2 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  48.45 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  50.79 
 
 		 405 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  45.71 
 
 		 394 aa  259  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  44.68 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  50.79 
 
 		 393 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  44.79 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  43.94 
 
 		 394 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  43.94 
 
 		 394 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  43.94 
 
 		 394 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  43.94 
 
 		 394 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  43.94 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 399 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  42.59 
 
 		 411 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 394 aa  235  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  46.13 
 
 		 407 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  46.79 
 
 		 329 aa  225  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5645  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  42.94 
 
 		 409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  40.51 
 
 		 423 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02501  hypothetical protein  47.77 
 
 		 293 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 400 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.44 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  38.18 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 395 aa  200  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  45.18 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 398 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  44.99 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3862  major facilitator transporter  44.99 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1193  major facilitator superfamily MFS_1  55.49 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754311  normal  0.247806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  38.67 
 
 		 398 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  34.45 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  34.45 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 407 aa  193  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  46.48 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  38.86 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 398 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 391 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 399 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 399 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 		 397 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  40.37 
 
 		 401 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  39.68 
 
 		 429 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  39.68 
 
 		 429 aa  186  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 		 389 aa  186  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  41.32 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  39.95 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2017  hypothetical protein  56.65 
 
 		 230 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3294  major facilitator family transporter  56.65 
 
 		 230 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.193712  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  39.68 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>