More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3663 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 402 aa  772    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  60.37 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  63.99 
 
 		 408 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  57.78 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  59.31 
 
 		 416 aa  359  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  57.92 
 
 		 416 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  60.77 
 
 		 404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  57.55 
 
 		 414 aa  352  5e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  51.59 
 
 		 401 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  51.84 
 
 		 401 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  52.37 
 
 		 402 aa  346  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  51.05 
 
 		 401 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  51.99 
 
 		 398 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  56.84 
 
 		 405 aa  332  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  52.21 
 
 		 409 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  50.39 
 
 		 399 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  50.39 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  50.39 
 
 		 399 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  53.06 
 
 		 422 aa  325  6e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  52.21 
 
 		 411 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  50.64 
 
 		 401 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  57.11 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  50.64 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  50.93 
 
 		 394 aa  319  7e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  53.46 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  51.46 
 
 		 411 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  51.46 
 
 		 411 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  51.19 
 
 		 411 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  51.95 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  50.26 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  50.26 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  50 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  50.26 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  51.29 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  51.93 
 
 		 411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  50 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  50.65 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  50.65 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  50.65 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  50.26 
 
 		 394 aa  299  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 399 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  50.52 
 
 		 403 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 399 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 385 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  49.75 
 
 		 394 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 399 aa  292  7e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2398  major facilitator family transporter  54.02 
 
 		 406 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2442  major facilitator family transporter  54.27 
 
 		 406 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2541  major facilitator transporter  54.27 
 
 		 443 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 399 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  48.02 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5645  major facilitator transporter  46.02 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  50.56 
 
 		 413 aa  265  8.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  47.49 
 
 		 407 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  38.23 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  50.38 
 
 		 395 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  43.4 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46800  hypothetical protein  53.47 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280439  hitchhiker  0.0000006863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4031  hypothetical protein  54.24 
 
 		 400 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151862  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 393 aa  246  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  50.31 
 
 		 329 aa  246  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0938  major facilitator superfamily MFS_1  46.02 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125076 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  39.03 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  39.03 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3862  major facilitator transporter  50.63 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  42.55 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 383 aa  236  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  47.26 
 
 		 423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  42.19 
 
 		 405 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  42.19 
 
 		 399 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  42.19 
 
 		 399 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  42.19 
 
 		 399 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  42.19 
 
 		 399 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  42.19 
 
 		 399 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  42.19 
 
 		 399 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  44.13 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02501  hypothetical protein  50 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 395 aa  225  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1850  major facilitator superfamily MFS_1  50.95 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 421 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 		 391 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 405 aa  216  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  39.79 
 
 		 395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 		 410 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>