168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2018 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2018  major facilitator transporter  100 
 
 
148 aa  290  7e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3293  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  290  7e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.791308  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2541  major facilitator transporter  98.65 
 
 
443 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2442  major facilitator family transporter  98.65 
 
 
406 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2398  major facilitator family transporter  97.1 
 
 
406 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  64.84 
 
 
426 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  65.12 
 
 
403 aa  166  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  69.57 
 
 
409 aa  163  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  69.23 
 
 
398 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  63.31 
 
 
422 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  61.48 
 
 
410 aa  144  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  58.82 
 
 
419 aa  144  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  59.42 
 
 
404 aa  141  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  68.32 
 
 
411 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  52.67 
 
 
416 aa  136  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  64.84 
 
 
428 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  59.42 
 
 
411 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  53.85 
 
 
402 aa  132  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  64.41 
 
 
408 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  67.52 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  67.52 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  67.52 
 
 
411 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  60.71 
 
 
402 aa  123  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  57.14 
 
 
414 aa  120  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  51.47 
 
 
401 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  51.47 
 
 
401 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0938  major facilitator superfamily MFS_1  58.49 
 
 
352 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125076 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  68.32 
 
 
411 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  56.56 
 
 
416 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  52.21 
 
 
401 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  50.81 
 
 
401 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5645  major facilitator transporter  50.47 
 
 
404 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  52.99 
 
 
393 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  52.99 
 
 
405 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
409 aa  98.6  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  46.09 
 
 
399 aa  97.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  40.77 
 
 
399 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  40.58 
 
 
399 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 
406 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 
406 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  40.77 
 
 
399 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  40.77 
 
 
385 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  40.77 
 
 
399 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4031  hypothetical protein  58.54 
 
 
400 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46800  hypothetical protein  60.23 
 
 
403 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280439  hitchhiker  0.0000006863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 
407 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.82 
 
 
394 aa  90.5  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1193  major facilitator superfamily MFS_1  52.14 
 
 
394 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754311  normal  0.247806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  41.23 
 
 
394 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  41.23 
 
 
394 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02501  hypothetical protein  41.59 
 
 
293 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  41.23 
 
 
394 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  41.23 
 
 
394 aa  87  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  41.23 
 
 
394 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  40.18 
 
 
399 aa  80.1  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  44.19 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  46.25 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  44.19 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  44.19 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2059  transporter, putative  46.72 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  42.86 
 
 
394 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  39.34 
 
 
395 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  41.67 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  41.67 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3862  major facilitator transporter  38.89 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  41.67 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  41.67 
 
 
394 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  39.67 
 
 
421 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3309  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
418 aa  75.5  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  39.2 
 
 
399 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  37.84 
 
 
399 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  40.48 
 
 
394 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  37.84 
 
 
399 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  36.28 
 
 
398 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  36.28 
 
 
429 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  36.28 
 
 
429 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  36.28 
 
 
398 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  36.28 
 
 
398 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  36.28 
 
 
398 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  36.28 
 
 
398 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  37.68 
 
 
411 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1850  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 
395 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  36.7 
 
 
399 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  39 
 
 
399 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  40.21 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  35.71 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  37.1 
 
 
383 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  41.75 
 
 
397 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  39.18 
 
 
399 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  39.18 
 
 
399 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  39.52 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  39.52 
 
 
405 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  33.66 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  39.52 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  39.52 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  39.52 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  39.52 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  39.52 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
423 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  34.21 
 
 
400 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>