More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0546 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  100 
 
 		 419 aa  800    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 426 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  48.35 
 
 		 410 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  49.23 
 
 		 416 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  47.49 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 416 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  48.15 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  47.03 
 
 		 414 aa  299  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  53.52 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 401 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  46.97 
 
 		 401 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  47.76 
 
 		 409 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  47.78 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  43.73 
 
 		 422 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  49.21 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 411 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 411 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 411 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  45.88 
 
 		 402 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  48.95 
 
 		 408 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  47.39 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  49.74 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  43.81 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  49.47 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  48.83 
 
 		 403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2541  major facilitator transporter  50 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2442  major facilitator family transporter  50 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2398  major facilitator family transporter  49.48 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 399 aa  259  6e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  48.06 
 
 		 411 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 399 aa  259  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 399 aa  259  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  45.85 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 394 aa  252  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  41.42 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  42.89 
 
 		 394 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  42.89 
 
 		 394 aa  249  9e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 394 aa  249  9e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  42.89 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  42.63 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 399 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  42.63 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 399 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 		 409 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  42.74 
 
 		 394 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  42.47 
 
 		 394 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  42.47 
 
 		 394 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  42.47 
 
 		 394 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 385 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  42.2 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5645  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  42.29 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  41.64 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0938  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  39.45 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 		 413 aa  202  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  42.72 
 
 		 329 aa  201  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 394 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  37.14 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  37.14 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  37.02 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  37.02 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  37.02 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  37.02 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  37.02 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  37.02 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  37.02 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  37.02 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46800  hypothetical protein  48.53 
 
 		 403 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280439  hitchhiker  0.0000006863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4031  hypothetical protein  48.69 
 
 		 400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151862  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  39.79 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3862  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 399 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  37.29 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  37.94 
 
 		 421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 415 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02501  hypothetical protein  42.61 
 
 		 293 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 404 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 405 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 405 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1850  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1490  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 		 415 aa  170  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.270736  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  32.92 
 
 		 415 aa  170  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 415 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  35.29 
 
 		 398 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>