More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2398 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2398  major facilitator family transporter  100 
 
 		 406 aa  776    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2541  major facilitator transporter  98.52 
 
 		 443 aa  763    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2442  major facilitator family transporter  98.52 
 
 		 406 aa  764    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  68.21 
 
 		 403 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  66.67 
 
 		 422 aa  438  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  63.45 
 
 		 398 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2017  hypothetical protein  99.13 
 
 		 230 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3294  major facilitator family transporter  99.13 
 
 		 230 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.193712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  66.93 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  64.81 
 
 		 409 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  62.97 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  63.19 
 
 		 411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  63.19 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  63.19 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  62.97 
 
 		 411 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  61.38 
 
 		 411 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  54.07 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  53.11 
 
 		 410 aa  349  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 401 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  57.55 
 
 		 408 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  51.01 
 
 		 416 aa  322  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  55.58 
 
 		 404 aa  322  9.000000000000001e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  49.36 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  50.9 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  50.76 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46800  hypothetical protein  62.5 
 
 		 403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280439  hitchhiker  0.0000006863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 419 aa  305  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0938  major facilitator superfamily MFS_1  55.52 
 
 		 352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  54.52 
 
 		 402 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4031  hypothetical protein  62.27 
 
 		 400 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  48.94 
 
 		 401 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  45.6 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 		 405 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  50.52 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  40.83 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2018  major facilitator transporter  95.95 
 
 		 148 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.483512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3293  hypothetical protein  95.95 
 
 		 148 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.791308  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  41.47 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  40.21 
 
 		 394 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5645  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 394 aa  244  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 394 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  40.21 
 
 		 394 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  40.21 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  39.95 
 
 		 394 aa  243  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  42.56 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1193  major facilitator superfamily MFS_1  54.65 
 
 		 394 aa  233  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754311  normal  0.247806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  40.48 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  42.03 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  40.21 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  40.21 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  40.21 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  40.21 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  39.95 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  41.43 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  41.43 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  41.43 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  39.54 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  41.43 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  41.43 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  41.43 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  41.43 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 394 aa  212  9e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 393 aa  202  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  41.98 
 
 		 429 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  41.98 
 
 		 429 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  41.98 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  41.98 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  41.98 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  41.98 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  41.98 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  40.51 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  42.37 
 
 		 423 aa  196  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  39.67 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  44.51 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  38.34 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 415 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>