More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1193 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1193  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 394 aa  712    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754311  normal  0.247806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  58.64 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  51.47 
 
 		 398 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  51.66 
 
 		 411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  51.83 
 
 		 409 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  51.83 
 
 		 422 aa  299  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  51.58 
 
 		 411 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  51.58 
 
 		 411 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  52.49 
 
 		 411 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  51.73 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  51.05 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2398  major facilitator family transporter  53.33 
 
 		 406 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2541  major facilitator transporter  53.59 
 
 		 443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2442  major facilitator family transporter  53.59 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  51.83 
 
 		 411 aa  272  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  43.01 
 
 		 410 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 426 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 401 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 416 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0938  major facilitator superfamily MFS_1  51.56 
 
 		 352 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  43.54 
 
 		 401 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  47.94 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 408 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 401 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  41.15 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  40.84 
 
 		 414 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 419 aa  223  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46800  hypothetical protein  54.66 
 
 		 403 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280439  hitchhiker  0.0000006863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4031  hypothetical protein  55.35 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151862  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 394 aa  209  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 		 407 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  38.28 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  38.28 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  38.02 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  38.02 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  43.46 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  38.28 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 		 406 aa  195  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 393 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 390 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  38.02 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  38.02 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  38.02 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  38.02 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5645  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  38.44 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 409 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  35.66 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 391 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 383 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 399 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  38.17 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 389 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3309  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 398 aa  163  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 413 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  34.76 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  37.7 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 447 aa  159  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 387 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  32.98 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  32.98 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  33.92 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 407 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3294  major facilitator family transporter  53.25 
 
 		 230 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.193712  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2017  hypothetical protein  53.25 
 
 		 230 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02501  hypothetical protein  39.38 
 
 		 293 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  37.02 
 
 		 423 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 410 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 405 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  33.25 
 
 		 405 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  37.19 
 
 		 396 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 405 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 405 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>