More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A3294 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A3294  major facilitator family transporter  100 
 
 		 230 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.193712  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2017  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2398  major facilitator family transporter  99.13 
 
 		 406 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2442  major facilitator family transporter  99.13 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2541  major facilitator transporter  99.13 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  66.81 
 
 		 422 aa  248  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  66.23 
 
 		 428 aa  245  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  68 
 
 		 403 aa  242  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  57.78 
 
 		 411 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  57.78 
 
 		 411 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  57.78 
 
 		 411 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  57.33 
 
 		 398 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  57.46 
 
 		 411 aa  235  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  57.46 
 
 		 411 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  59.55 
 
 		 409 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  62.22 
 
 		 411 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46800  hypothetical protein  62.27 
 
 		 403 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280439  hitchhiker  0.0000006863 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 401 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4031  hypothetical protein  62.9 
 
 		 400 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151862  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  52.68 
 
 		 408 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  49.55 
 
 		 416 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  47.14 
 
 		 410 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 426 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  46.7 
 
 		 416 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  46.02 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  45.58 
 
 		 401 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  51.85 
 
 		 404 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0938  major facilitator superfamily MFS_1  53.33 
 
 		 352 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  50.88 
 
 		 402 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 401 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  46.22 
 
 		 401 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  42.48 
 
 		 401 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  47.35 
 
 		 405 aa  148  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  38.36 
 
 		 329 aa  148  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  38.36 
 
 		 394 aa  148  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  38.36 
 
 		 394 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  38.36 
 
 		 394 aa  148  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 394 aa  148  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  47.79 
 
 		 393 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  38.36 
 
 		 394 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 399 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 394 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  38.36 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  43.81 
 
 		 419 aa  145  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 399 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  38.81 
 
 		 394 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  38.81 
 
 		 394 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  38.81 
 
 		 394 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  38.81 
 
 		 394 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  38.81 
 
 		 394 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  41.47 
 
 		 385 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 407 aa  141  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  41.74 
 
 		 402 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 399 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 406 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 403 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  42.08 
 
 		 402 aa  138  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 		 402 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 		 399 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 393 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  40.74 
 
 		 407 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 		 406 aa  135  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  41.23 
 
 		 399 aa  134  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 395 aa  134  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  40.89 
 
 		 399 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  40.89 
 
 		 405 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 399 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  40.89 
 
 		 399 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  40.89 
 
 		 399 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  40.89 
 
 		 399 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 399 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  40.89 
 
 		 399 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  40.89 
 
 		 399 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 		 399 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  40.17 
 
 		 398 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 404 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 		 413 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 405 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 405 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  41.7 
 
 		 399 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 394 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  36.04 
 
 		 389 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  36.04 
 
 		 389 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 400 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  39.45 
 
 		 447 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 389 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  42.51 
 
 		 413 aa  128  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 398 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 405 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 395 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 405 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 412 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 405 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 412 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 404 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>