More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1033 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
413 aa  808    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  60.93 
 
 
407 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  63.2 
 
 
402 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  59.66 
 
 
401 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  62.94 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  58.44 
 
 
398 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  59.02 
 
 
396 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  52.45 
 
 
389 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  52.45 
 
 
389 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  58.76 
 
 
406 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  48.22 
 
 
393 aa  352  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  59.34 
 
 
408 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  48.44 
 
 
395 aa  326  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  47.61 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  48.26 
 
 
398 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  44.02 
 
 
405 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  44.8 
 
 
405 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  45.97 
 
 
405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  45.71 
 
 
405 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  45.71 
 
 
405 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  47.11 
 
 
404 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  47.45 
 
 
447 aa  306  6e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  51.72 
 
 
401 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  45.45 
 
 
405 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  47.15 
 
 
400 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  47.15 
 
 
400 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  47.15 
 
 
400 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  44.47 
 
 
404 aa  293  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  39.64 
 
 
392 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  40.42 
 
 
406 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  40.42 
 
 
406 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  40.31 
 
 
403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  46.97 
 
 
388 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  50 
 
 
399 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  44.28 
 
 
416 aa  276  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  47.75 
 
 
399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  45.48 
 
 
400 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  45.27 
 
 
405 aa  266  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  46.49 
 
 
399 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  46.75 
 
 
399 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  49.59 
 
 
402 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  50.79 
 
 
409 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  38.55 
 
 
399 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  38.55 
 
 
399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  43.72 
 
 
422 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  39.85 
 
 
385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  39.9 
 
 
399 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  39.04 
 
 
399 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  40.05 
 
 
411 aa  223  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  42.34 
 
 
433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  37.4 
 
 
399 aa  216  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  37.4 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  37.4 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  42.3 
 
 
431 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  45.71 
 
 
427 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  33.51 
 
 
394 aa  213  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  35.05 
 
 
403 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  41.75 
 
 
415 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  40.12 
 
 
399 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  38.98 
 
 
413 aa  207  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  41.16 
 
 
389 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  40.57 
 
 
404 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 
399 aa  206  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  42.31 
 
 
399 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  37.21 
 
 
395 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 
406 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  38.18 
 
 
394 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  41.64 
 
 
400 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  42.89 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 
406 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  35.38 
 
 
407 aa  200  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  42.68 
 
 
427 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  42.68 
 
 
427 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000378785  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  38.87 
 
 
383 aa  199  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  38.3 
 
 
425 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 
399 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  37.92 
 
 
394 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  37.92 
 
 
394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  37.92 
 
 
394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  45.33 
 
 
413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  37.92 
 
 
394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  39.27 
 
 
401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  37.66 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 
399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  35.38 
 
 
426 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  38.44 
 
 
394 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  38.18 
 
 
394 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  39.4 
 
 
403 aa  196  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  39.37 
 
 
394 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  39.37 
 
 
394 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  39.37 
 
 
394 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 
403 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  38.89 
 
 
405 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 
397 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  39.48 
 
 
399 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  39.84 
 
 
429 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  39.48 
 
 
399 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  39.37 
 
 
394 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  39.48 
 
 
399 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>