More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0938 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0938  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 352 aa  673    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125076 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  58.81 
 
 		 398 aa  348  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  57.95 
 
 		 411 aa  342  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  58.81 
 
 		 409 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  59.09 
 
 		 411 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  59.09 
 
 		 411 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  58.81 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  58.81 
 
 		 411 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  56.73 
 
 		 422 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  57.02 
 
 		 428 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  56.78 
 
 		 403 aa  298  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3583  major facilitator transporter  58.81 
 
 		 411 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2442  major facilitator family transporter  55.17 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2541  major facilitator transporter  55.17 
 
 		 443 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.575651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2398  major facilitator family transporter  54.6 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  45.64 
 
 		 410 aa  245  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  44.32 
 
 		 401 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  44.6 
 
 		 401 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  44.32 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 401 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  43.59 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46800  hypothetical protein  59.3 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280439  hitchhiker  0.0000006863 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1976  permease, major facilitator superfamily  44.19 
 
 		 416 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  46.59 
 
 		 405 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4031  hypothetical protein  57.95 
 
 		 400 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0704  major facilitator transporter  47.44 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.964819  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2986  major facilitator superfamily permease  42.78 
 
 		 414 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000015466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  47.46 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  46.8 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5645  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 399 aa  206  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.23 
 
 		 406 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 402 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 419 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 		 406 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  40.12 
 
 		 400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 399 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  36.83 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  46.02 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  36.83 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  37.92 
 
 		 409 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 404 aa  189  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  37.4 
 
 		 394 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 394 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  37.4 
 
 		 394 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  37.12 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  37.4 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 383 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1193  major facilitator superfamily MFS_1  51.53 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754311  normal  0.247806 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  38.7 
 
 		 394 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  37.22 
 
 		 411 aa  173  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  38.7 
 
 		 394 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  38.7 
 
 		 394 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  37.12 
 
 		 394 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  38.7 
 
 		 394 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 		 423 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 		 399 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  38.7 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6216  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  37.82 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  37.85 
 
 		 399 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  37.72 
 
 		 398 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  37.72 
 
 		 398 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  37.72 
 
 		 398 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  37.72 
 
 		 398 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  37.72 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  37.72 
 
 		 398 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  37.72 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 399 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  40.23 
 
 		 403 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  37.77 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 397 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  35.69 
 
 		 395 aa  159  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  37.85 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  37.85 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  33.24 
 
 		 415 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3294  major facilitator family transporter  51.87 
 
 		 230 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.193712  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2017  hypothetical protein  51.87 
 
 		 230 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>