More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6375 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1453  major facilitator transporter  100 
 
 		 401 aa  755    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6375  major facilitator transporter  100 
 
 		 401 aa  755    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6915  major facilitator transporter  80 
 
 		 401 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1709  major facilitator transporter  61.11 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  29.61 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 400 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 398 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  32.15 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  32.15 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  32.15 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  31.88 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  32.15 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  32.15 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  32.15 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 		 415 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 399 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  32.71 
 
 		 398 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  31.35 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  31.35 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 385 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  31.35 
 
 		 394 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  31.35 
 
 		 394 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 394 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 399 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  30.79 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  30.81 
 
 		 394 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  31.06 
 
 		 394 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  30.81 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  30.81 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  32.28 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  33.16 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5645  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 395 aa  119  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 410 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  32.49 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  32.49 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  32.49 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  32.49 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  32.49 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  32.49 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  32.49 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.98 
 
 		 404 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 399 aa  116  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 399 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 403 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>