More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1490 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1490  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  787    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.270736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 394 aa  235  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 399 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  40.9 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  40.9 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  40.9 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  40.9 
 
 		 394 aa  229  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  41.6 
 
 		 411 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  40.37 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 399 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 399 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 385 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  41.16 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 		 406 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 		 406 aa  216  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  41.8 
 
 		 394 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  42.16 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  42.16 
 
 		 394 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  42.16 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  42.16 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 		 399 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  41.93 
 
 		 399 aa  206  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 403 aa  203  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  42.98 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  41.78 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 400 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  41.88 
 
 		 329 aa  192  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  43.31 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  42.33 
 
 		 429 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1124  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 416 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5688  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.492317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  42.33 
 
 		 429 aa  190  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  42.33 
 
 		 398 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  37.81 
 
 		 421 aa  190  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  42.33 
 
 		 398 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  42.33 
 
 		 398 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  42.59 
 
 		 398 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  42.33 
 
 		 398 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  39.59 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0546  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 419 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  37.72 
 
 		 401 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1426  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  37.46 
 
 		 391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  38.16 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  37.27 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3862  major facilitator transporter  40.52 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.0890532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 395 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  43.6 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  41.97 
 
 		 399 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1462  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.554548  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  35.65 
 
 		 389 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  37.85 
 
 		 405 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  35.65 
 
 		 389 aa  176  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  37.85 
 
 		 399 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  37.85 
 
 		 399 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  37.85 
 
 		 399 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  37.85 
 
 		 399 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  37.85 
 
 		 399 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  37.85 
 
 		 399 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  35.69 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3110  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 411 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 403 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 399 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  39.23 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3735  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364507  normal  0.0404354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3663  twin-arginine translocation pathway signal  40.31 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000185127  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 394 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 402 aa  170  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 394 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  38.31 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02501  hypothetical protein  42.49 
 
 		 293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  38.25 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0412  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.213792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>