More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1416 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0462  putative beta-N-acetylglucosaminidase  100 
 
 
467 aa  934    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0430321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  99.36 
 
 
699 aa  931    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  99.57 
 
 
699 aa  932    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  93.58 
 
 
699 aa  880    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1416  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 
467 aa  934    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  99.36 
 
 
699 aa  930    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  61.3 
 
 
734 aa  558  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.3 
 
 
598 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  37.77 
 
 
688 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  32.76 
 
 
633 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.99 
 
 
698 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  36.08 
 
 
845 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  43.15 
 
 
673 aa  177  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  28.66 
 
 
637 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  33.76 
 
 
604 aa  160  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.34 
 
 
543 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  39.37 
 
 
631 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  39.08 
 
 
966 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.09 
 
 
600 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.71 
 
 
596 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  34.71 
 
 
1012 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  32.79 
 
 
990 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.99 
 
 
528 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 
520 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.57 
 
 
543 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.56 
 
 
558 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.27 
 
 
618 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.66 
 
 
1002 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  35.19 
 
 
552 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  41 
 
 
420 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  40.41 
 
 
427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  31.55 
 
 
541 aa  127  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.22 
 
 
582 aa  127  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  34.17 
 
 
589 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.01 
 
 
583 aa  124  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  30.42 
 
 
992 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  33.93 
 
 
444 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  40.21 
 
 
656 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.84 
 
 
568 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.33 
 
 
478 aa  119  9e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  38.67 
 
 
538 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.66 
 
 
580 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.29 
 
 
1018 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.04 
 
 
976 aa  117  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.42 
 
 
953 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  36.32 
 
 
542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  32.8 
 
 
592 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.2 
 
 
573 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.18 
 
 
534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.18 
 
 
534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.47 
 
 
552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  33.98 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  32.29 
 
 
538 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  29.15 
 
 
997 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  41.43 
 
 
511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.37 
 
 
591 aa  110  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.7 
 
 
594 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.67 
 
 
511 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  29.72 
 
 
971 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  30.38 
 
 
543 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  27.85 
 
 
517 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.38 
 
 
537 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 
361 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  30.04 
 
 
1003 aa  103  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.84 
 
 
392 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.56 
 
 
387 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 
624 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  30.61 
 
 
585 aa  100  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  38.85 
 
 
490 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
363 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  32.61 
 
 
503 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  32.77 
 
 
575 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.01 
 
 
398 aa  99.8  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  42.98 
 
 
498 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.36 
 
 
403 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  34.21 
 
 
375 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  33.46 
 
 
499 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  32.3 
 
 
549 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.67 
 
 
426 aa  97.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  30.05 
 
 
544 aa  96.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.31 
 
 
490 aa  96.7  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.33 
 
 
365 aa  96.3  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  32.61 
 
 
520 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  39.44 
 
 
492 aa  96.3  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.98 
 
 
373 aa  95.5  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  34.92 
 
 
350 aa  95.5  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.43 
 
 
358 aa  94.4  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  29.51 
 
 
544 aa  93.6  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.4 
 
 
484 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  33.86 
 
 
374 aa  93.6  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  36.42 
 
 
365 aa  93.2  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  32.61 
 
 
382 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.42 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.42 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  36.87 
 
 
365 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0117  glycoside hydrolase family 3 protein  30.29 
 
 
465 aa  92.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  31.75 
 
 
354 aa  92  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  32.91 
 
 
575 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0119  glycoside hydrolase family 3 protein  29.71 
 
 
467 aa  91.3  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.16 
 
 
379 aa  91.3  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>