147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1029 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2088  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0852077  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0734  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1029  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  480  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0803  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0715  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147759  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1887  hypothetical protein  97.95 
 
 
453 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  38.3 
 
 
443 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  36.8 
 
 
451 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  36.8 
 
 
451 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  36.55 
 
 
444 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  37.82 
 
 
455 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  38.54 
 
 
445 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  35.59 
 
 
444 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.02 
 
 
458 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  35.17 
 
 
444 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  37.92 
 
 
445 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  33.46 
 
 
472 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  33.19 
 
 
443 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  33.9 
 
 
444 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  32.77 
 
 
445 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  32.74 
 
 
445 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  34.6 
 
 
445 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.19 
 
 
445 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.19 
 
 
445 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  32.22 
 
 
447 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  32.77 
 
 
443 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0024  hypothetical protein  31.93 
 
 
301 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.668164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  32.35 
 
 
443 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  27.97 
 
 
444 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  32.35 
 
 
443 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  32.77 
 
 
443 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  32.77 
 
 
443 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  32.13 
 
 
467 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  32.13 
 
 
454 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  32.13 
 
 
467 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  32.13 
 
 
467 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  32.13 
 
 
467 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  32.13 
 
 
467 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  34.44 
 
 
448 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  34.44 
 
 
448 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  31.2 
 
 
468 aa  99.4  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  31.73 
 
 
467 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  31.36 
 
 
444 aa  99  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  27.62 
 
 
442 aa  98.2  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  27.12 
 
 
444 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  28.45 
 
 
441 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  30.87 
 
 
447 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  28.45 
 
 
441 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  29.91 
 
 
448 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  29.91 
 
 
448 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  29.91 
 
 
448 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  29.91 
 
 
448 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  32.35 
 
 
448 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  30.53 
 
 
448 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  28.87 
 
 
447 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  30.53 
 
 
448 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  30.53 
 
 
448 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  31.86 
 
 
443 aa  94.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  34.15 
 
 
445 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  32.06 
 
 
444 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  28.04 
 
 
445 aa  92.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  29.06 
 
 
448 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  26.97 
 
 
449 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  32.68 
 
 
445 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  26.97 
 
 
449 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  30 
 
 
448 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  32.68 
 
 
445 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  26.97 
 
 
449 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  30.13 
 
 
446 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  32.14 
 
 
446 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  28.94 
 
 
448 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  27 
 
 
446 aa  89  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  30.71 
 
 
443 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  30.89 
 
 
443 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  29.29 
 
 
449 aa  85.1  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  33.33 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  30.61 
 
 
443 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  30.89 
 
 
443 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  27.12 
 
 
440 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  28.03 
 
 
447 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  28.03 
 
 
447 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  28.03 
 
 
447 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  28.03 
 
 
447 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  31.6 
 
 
445 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  29.57 
 
 
443 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  27.62 
 
 
480 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  27.62 
 
 
480 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1181  putative type VI secretion protein VasE-1  26.48 
 
 
438 aa  76.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100124  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  27.62 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  27.62 
 
 
452 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  30 
 
 
449 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  29.13 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  30.8 
 
 
447 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  27.23 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2503  type VI secretion protein  30 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2933  type VI secretion protein  28.31 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159534  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4910  type VI secretion protein, VC_A0114 family  29.55 
 
 
448 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000188253  hitchhiker  0.00743846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  28.77 
 
 
448 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3639  hypothetical protein  29.68 
 
 
468 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  26.96 
 
 
447 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>