More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6344 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6344  dihydrodipicolinate synthase (DHDPS)  100 
 
 		 309 aa  614  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  0.0384677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0658  dihydrodipicolinate synthase  58.18 
 
 		 315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3407  dihydrodipicolinate synthase  52.9 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2147  dihydrodipicolinate synthase  53.21 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0181413 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  42.46 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  42.11 
 
 		 291 aa  215  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  39.16 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  41.9 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  41.9 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  41.9 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  42.25 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  41.9 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  41.9 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  41.9 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  41.9 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  41.54 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  42.31 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  42.76 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 319 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 296 aa  205  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  40.44 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 		 326 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  42.55 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  40.77 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  40.51 
 
 		 300 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 320 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  40.77 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  39.16 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  42.01 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  40.35 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  37.37 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  38.95 
 
 		 292 aa  199  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  41.26 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  41.26 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  40.56 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  40.56 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  35.14 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  40.64 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  40.62 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  39.1 
 
 		 290 aa  193  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  38.65 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  40.69 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  39.44 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  38.73 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  39.44 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  37.76 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 291 aa  191  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  36.81 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  37.76 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  37.76 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  35.54 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  38.73 
 
 		 292 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  39.22 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  37.91 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  36.23 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  36.84 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  34.95 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  39.44 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  37.41 
 
 		 293 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  41.7 
 
 		 292 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  38.78 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  41.03 
 
 		 296 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  35.89 
 
 		 292 aa  188  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  38.33 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  38.81 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  37.67 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  36.81 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  38.25 
 
 		 296 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  34.95 
 
 		 291 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  34.72 
 
 		 292 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  36.68 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>