More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2147 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2147  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 294 aa  573  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0181413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0658  dihydrodipicolinate synthase  56.16 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6344  dihydrodipicolinate synthase (DHDPS)  52.5 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232972  normal  0.0384677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3407  dihydrodipicolinate synthase  53.09 
 
 		 307 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  42.4 
 
 		 296 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  42.11 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  40.73 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  42.25 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  39.66 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  37.89 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  39.71 
 
 		 287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  40.97 
 
 		 292 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 292 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  49.52 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  40.15 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  40.15 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  36.84 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  38.25 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  40.15 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  38.95 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  40.15 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  38.95 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  38.95 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  40.15 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  40.15 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  38.95 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  40.15 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  41.46 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  35.54 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  44.71 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  39.27 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  39.64 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  36.14 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 292 aa  179  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 292 aa  179  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 292 aa  178  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 291 aa  178  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  40.35 
 
 		 326 aa  178  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  37.72 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  40.49 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  35.4 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  41.74 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  36.84 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  45.28 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  36.49 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  37.1 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  41.34 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  38.75 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  39.03 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1735  dihydrodipicolinate synthase  39.64 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00310784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  38.06 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  35.54 
 
 		 291 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  39.45 
 
 		 293 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  38.75 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  38.75 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  40.57 
 
 		 290 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  43.27 
 
 		 292 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 300 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  43.27 
 
 		 292 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  43.27 
 
 		 292 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  43.27 
 
 		 292 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  43.96 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  37.87 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  44.23 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 		 292 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  39.1 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  38.7 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  38.95 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  38.75 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  37.41 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  43.96 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  42.31 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  43.96 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  34.97 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  39.85 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  37.5 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  36.01 
 
 		 293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>