More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_03450 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_03450  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  915    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0525877  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0072  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.34 
 
 
446 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.69 
 
 
491 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107031  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0287  ferredoxin, 4Fe-4S  54.61 
 
 
420 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.21 
 
 
1046 aa  346  5e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.24 
 
 
1032 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  43.97 
 
 
1007 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.23 
 
 
1007 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.92 
 
 
1025 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  42.44 
 
 
984 aa  322  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.42 
 
 
1025 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.45 
 
 
989 aa  319  7e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.63 
 
 
1038 aa  316  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  42.73 
 
 
973 aa  316  6e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.54 
 
 
995 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.31 
 
 
983 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  44.39 
 
 
974 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.22 
 
 
1005 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.44 
 
 
961 aa  298  9e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.41 
 
 
990 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.46 
 
 
990 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.98 
 
 
990 aa  282  9e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.53 
 
 
976 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.41 
 
 
978 aa  266  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  37.41 
 
 
973 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.94 
 
 
962 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  38.5 
 
 
952 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  35.54 
 
 
1024 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.19 
 
 
1034 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  34.4 
 
 
1015 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.59 
 
 
999 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  32.5 
 
 
999 aa  223  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.4 
 
 
1022 aa  223  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  34.88 
 
 
967 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.66 
 
 
906 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  33.96 
 
 
1013 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.26 
 
 
966 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  30.45 
 
 
975 aa  219  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  35.29 
 
 
975 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  36.67 
 
 
987 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  35.92 
 
 
976 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  37.1 
 
 
1050 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34 
 
 
973 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.85 
 
 
989 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  35.2 
 
 
1070 aa  213  5.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.18 
 
 
1037 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  37.47 
 
 
1050 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.44 
 
 
1031 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.19 
 
 
1011 aa  211  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.55 
 
 
950 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  37.53 
 
 
1052 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.75 
 
 
948 aa  209  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  35.07 
 
 
1055 aa  208  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.43 
 
 
1009 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.7 
 
 
968 aa  206  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.56 
 
 
1000 aa  206  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.8 
 
 
971 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  30.54 
 
 
967 aa  205  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.75 
 
 
983 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.5 
 
 
991 aa  202  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  32.27 
 
 
984 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.59 
 
 
976 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.32 
 
 
1006 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.45 
 
 
1015 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.56 
 
 
945 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  33.18 
 
 
1043 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.21 
 
 
947 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.4 
 
 
977 aa  190  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  32.72 
 
 
976 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.4 
 
 
1023 aa  190  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  34.87 
 
 
894 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.26 
 
 
1050 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
1014 aa  186  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.71 
 
 
974 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  32.95 
 
 
996 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  33.72 
 
 
1024 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.41 
 
 
1035 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.44 
 
 
944 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  34.51 
 
 
949 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.35 
 
 
1028 aa  177  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  30.82 
 
 
930 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  31.34 
 
 
1032 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  33.66 
 
 
1023 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.32 
 
 
977 aa  170  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  31.33 
 
 
997 aa  169  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.63 
 
 
997 aa  169  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  31.87 
 
 
993 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  30.63 
 
 
1010 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  30.32 
 
 
985 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.97 
 
 
995 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1061  hypothetical protein  43.5 
 
 
203 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0866  FAD linked oxidase domain protein  27.73 
 
 
1020 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  30.28 
 
 
978 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4691  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 
741 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154904  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0362  protein of unknown function DUF162  27.15 
 
 
738 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  25.85 
 
 
1002 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0069  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.99 
 
 
409 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  26.11 
 
 
1006 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4561  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  26.95 
 
 
453 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2667  protein of unknown function DUF162  28.42 
 
 
727 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>