More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0866 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0866  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 1020 aa  2084    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  29.65 
 
 		 996 aa  405  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.93 
 
 		 978 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  28.91 
 
 		 973 aa  382  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.7 
 
 		 962 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  28.8 
 
 		 1024 aa  375  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  28.13 
 
 		 1055 aa  375  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.22 
 
 		 1023 aa  375  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.54 
 
 		 1035 aa  376  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.61 
 
 		 976 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  28.21 
 
 		 1070 aa  370  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.76 
 
 		 1015 aa  366  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  26.43 
 
 		 967 aa  357  6.999999999999999e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  27.34 
 
 		 1032 aa  352  1e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.95 
 
 		 991 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.76 
 
 		 1007 aa  347  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  27.59 
 
 		 1023 aa  345  2.9999999999999997e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.8 
 
 		 984 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  28.21 
 
 		 1007 aa  344  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.65 
 
 		 995 aa  342  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  27.63 
 
 		 973 aa  340  7e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  27.69 
 
 		 1014 aa  337  5.999999999999999e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.01 
 
 		 983 aa  337  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.14 
 
 		 1038 aa  337  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.06 
 
 		 961 aa  335  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.28 
 
 		 1005 aa  333  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.97 
 
 		 1011 aa  331  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.17 
 
 		 976 aa  328  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.98 
 
 		 1009 aa  324  6e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.54 
 
 		 977 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  29.24 
 
 		 974 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.95 
 
 		 990 aa  319  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.05 
 
 		 990 aa  318  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  27.88 
 
 		 967 aa  317  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.76 
 
 		 1046 aa  317  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.48 
 
 		 989 aa  315  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.15 
 
 		 968 aa  314  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25 
 
 		 971 aa  313  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.95 
 
 		 990 aa  313  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.55 
 
 		 1032 aa  311  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.95 
 
 		 983 aa  308  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.06 
 
 		 1025 aa  304  7.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.22 
 
 		 989 aa  302  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  25.58 
 
 		 975 aa  301  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.34 
 
 		 1025 aa  301  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  26.25 
 
 		 1013 aa  300  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  26.32 
 
 		 930 aa  297  6e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.56 
 
 		 973 aa  295  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.5 
 
 		 1034 aa  291  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  28.2 
 
 		 952 aa  291  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  27.81 
 
 		 976 aa  291  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  26.63 
 
 		 1024 aa  288  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  26.26 
 
 		 984 aa  288  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.93 
 
 		 950 aa  280  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  26.54 
 
 		 987 aa  275  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.04 
 
 		 1000 aa  274  6e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.4 
 
 		 945 aa  273  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.72 
 
 		 999 aa  273  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  24.45 
 
 		 976 aa  268  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  25.02 
 
 		 999 aa  268  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.57 
 
 		 948 aa  268  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25 
 
 		 974 aa  266  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  27.86 
 
 		 1043 aa  265  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  27.06 
 
 		 949 aa  265  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.28 
 
 		 1022 aa  264  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.17 
 
 		 1037 aa  264  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  25.27 
 
 		 1015 aa  263  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.98 
 
 		 995 aa  262  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1050 aa  261  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.24 
 
 		 1031 aa  261  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.63 
 
 		 947 aa  259  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  26.68 
 
 		 1010 aa  257  8e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.36 
 
 		 1028 aa  257  9e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  26.14 
 
 		 975 aa  256  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.17 
 
 		 944 aa  255  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.45 
 
 		 997 aa  253  9.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  25.47 
 
 		 1052 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  23.82 
 
 		 1002 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  23.72 
 
 		 1006 aa  252  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  25.39 
 
 		 1050 aa  252  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.69 
 
 		 1013 aa  249  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1737  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.88 
 
 		 1013 aa  248  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.187765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1593  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.79 
 
 		 1013 aa  248  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125155  normal  0.43288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1668  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.79 
 
 		 1013 aa  247  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157229  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  25.72 
 
 		 985 aa  246  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.23 
 
 		 1024 aa  242  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.38 
 
 		 1006 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  24.9 
 
 		 997 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  22.88 
 
 		 1013 aa  240  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  24.4 
 
 		 1018 aa  240  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  24.4 
 
 		 1018 aa  240  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1018 aa  240  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  24.4 
 
 		 1018 aa  240  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  24.95 
 
 		 1012 aa  239  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.5 
 
 		 1018 aa  239  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2480  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.4 
 
 		 1013 aa  239  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  25.33 
 
 		 966 aa  238  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  26.58 
 
 		 993 aa  238  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2600  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.24 
 
 		 1013 aa  238  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.575227  normal  0.0164973 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  24.33 
 
 		 1018 aa  238  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0186702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>