76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_R0068 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_R0068  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 338 bp  670    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.400378  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0035  RNA component of RNaseP  86.54 
 
 		 334 bp  218  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15110  Bacterial RNase P class A  81.54 
 
 		 324 bp  145  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  87.77 
 
 		 316 bp  141  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  92.05 
 
 		 348 bp  119  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0045  RNA component of RNaseP  91.21 
 
 		 312 bp  117  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  91.95 
 
 		 340 bp  117  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  93.59 
 
 		 348 bp  115  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09520  Bacterial RNase P class A  81.64 
 
 		 325 bp  115  8.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  91.76 
 
 		 353 bp  113  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  91.76 
 
 		 345 bp  113  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  91.76 
 
 		 356 bp  113  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0039  RNA component of RNaseP  82.46 
 
 		 341 bp  111  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0961177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0036  rnpB RNA  89.77 
 
 		 337 bp  103  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0048  RNA component of RNaseP  90.36 
 
 		 333 bp  101  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.231595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0038  RNA component of RNaseP  91.03 
 
 		 354 bp  99.6  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0631532  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  90.24 
 
 		 328 bp  99.6  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  88.64 
 
 		 309 bp  95.6  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  89.02 
 
 		 326 bp  91.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0025  RNA component of RNaseP  89.02 
 
 		 184 bp  91.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  88.37 
 
 		 369 bp  91.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    88.24 
 
 		 352 bp  89.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  88.24 
 
 		 352 bp  89.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  88.24 
 
 		 318 bp  89.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  86.32 
 
 		 427 bp  85.7  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12130  Bacterial RNase P class A  82.96 
 
 		 317 bp  85.7  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0161879  normal  0.0949657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  87.8 
 
 		 328 bp  83.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  87.8 
 
 		 332 bp  83.8  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  87.65 
 
 		 326 bp  81.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0034  RNA component of RNaseP  86.52 
 
 		 339 bp  81.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  86.36 
 
 		 339 bp  79.8  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  86.21 
 
 		 354 bp  77.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16640  Bacterial RNase P class A  85.87 
 
 		 299 bp  71.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0340654  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0034  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 306 bp  69.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0051  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 345 bp  67.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384072  normal  0.735401 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  84.09 
 
 		 328 bp  63.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0026  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 326 bp  61.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0059  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 343 bp  60  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0109691  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4508  RNase P RNA component precursor RnpB  85.19 
 
 		 396 bp  58  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0033  RNA component of RNaseP  94.59 
 
 		 304 bp  58  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256591  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0013  RNA_RNaseP_classA  96.97 
 
 		 313 bp  58  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.336548  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  94.59 
 
 		 308 bp  58  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1382  Bacterial RNase P class A  96.97 
 
 		 312 bp  58  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  91.11 
 
 		 323 bp  58  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  83.95 
 
 		 373 bp  58  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 303 bp  54  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    100 
 
 		 303 bp  54  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    100 
 
 		 358 bp  54  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 398 bp  54  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0043    94.29 
 
 		 293 bp  54  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00678643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  94.29 
 
 		 301 bp  54  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    96.67 
 
 		 330 bp  52  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  100 
 
 		 302 bp  52  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 305 bp  52  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    85.37 
 
 		 295 bp  52  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0053  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 347 bp  52  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0053  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 347 bp  52  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0037  RNaseP RNA  94.12 
 
 		 347 bp  52  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0035  RNA component of RNaseP  86.36 
 
 		 284 bp  52  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 332 bp  50.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  82.72 
 
 		 301 bp  50.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0017  RNA component of RNaseP  82.89 
 
 		 307 bp  48.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316864  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0032  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 333 bp  48.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.148898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0034  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 333 bp  48.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0944967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0097  RNA component of RNaseP  84.72 
 
 		 346 bp  48.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0015  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 313 bp  48.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0681345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  96.3 
 
 		 296 bp  46.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0020  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 336 bp  46.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00784007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    96.3 
 
 		 295 bp  46.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 295 bp  46.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 295 bp  46.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  96.3 
 
 		 294 bp  46.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0127  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 304 bp  46.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0073  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 299 bp  46.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0014  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 331 bp  46.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000221757  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0051  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 297 bp  46.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>