198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_R0017 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    89.01 
 
 		 358 bp  204  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  85.35 
 
 		 398 bp  161  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    83.25 
 
 		 303 bp  131  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0035  RNA component of RNaseP  84.97 
 
 		 363 bp  129  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.531572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0019  RNA component of RNaseP  86.82 
 
 		 297 bp  121  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000680683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  92.11 
 
 		 315 bp  103  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0003  RNA component of RNaseP  92.11 
 
 		 315 bp  103  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0068  RNA component of RNaseP  91.03 
 
 		 372 bp  99.6  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.415959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    91.03 
 
 		 295 bp  99.6  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0053  RNase P  90.79 
 
 		 326 bp  95.6  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0043  RNA component of RNaseP  89.47 
 
 		 213 bp  87.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000487494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0012  RNA component of RNaseP  89.47 
 
 		 356 bp  87.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0591334 
 
 
-
 
NC_002936  DET_DernpB1  sRNA  88.46 
 
 		 261 bp  83.8  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.573184  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  88.46 
 
 		 309 bp  83.8  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0006  RNAse P  88.46 
 
 		 304 bp  83.8  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.161973  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  90.12 
 
 		 318 bp  81.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  90.12 
 
 		 427 bp  81.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  90.12 
 
 		 352 bp  81.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    90.12 
 
 		 352 bp  81.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  87.5 
 
 		 298 bp  79.8  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0012  RNA component of RNaseP  88.16 
 
 		 357 bp  79.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  89.16 
 
 		 339 bp  77.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  87.18 
 
 		 359 bp  75.8  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  88.46 
 
 		 301 bp  75.8  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  95.65 
 
 		 323 bp  75.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  87.18 
 
 		 332 bp  75.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0003  RNase P  91.94 
 
 		 331 bp  75.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0034  RNA component of RNaseP  86.67 
 
 		 339 bp  75.8  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  88.24 
 
 		 328 bp  73.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0024  RNA component of RNase P  88.31 
 
 		 349 bp  73.8  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.699982  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0025  RNA component of RNaseP  90.16 
 
 		 184 bp  73.8  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 369 bp  73.8  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 353 bp  73.8  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  88.89 
 
 		 354 bp  73.8  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 356 bp  73.8  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1398  sRNA  95.56 
 
 		 422 bp  73.8  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0036  rnpB RNA  86.84 
 
 		 337 bp  71.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  80.93 
 
 		 348 bp  71.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0029  RNA component of RNaseP  92.86 
 
 		 364 bp  71.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.830354  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  86.46 
 
 		 326 bp  71.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  86.08 
 
 		 302 bp  69.9  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0034  RNA component of RNaseP  97.67 
 
 		 333 bp  69.9  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0634985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0035  RNA component of RNaseP  97.37 
 
 		 326 bp  67.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0052  RNA component of RNaseP  97.37 
 
 		 326 bp  67.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  85.9 
 
 		 328 bp  67.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0005  RNA component of RNaseP  97.37 
 
 		 381 bp  67.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.328274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0035  RNA component of RNaseP  97.37 
 
 		 310 bp  67.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100496 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0035  RNaseP RNA  90.32 
 
 		 378 bp  67.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0021  RNA component of RNaseP  97.37 
 
 		 359 bp  67.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0041  RNA component of RNaseP  97.37 
 
 		 329 bp  67.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0029  RNA component of RNaseP  85.9 
 
 		 298 bp  67.9  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.538332  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0036  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 312 bp  65.9  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.792422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  85.39 
 
 		 326 bp  65.9  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  85.39 
 
 		 340 bp  65.9  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0055  RNase P  100 
 
 		 338 bp  65.9  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0025  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 332 bp  63.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0017  RNA component of RNaseP  95 
 
 		 307 bp  63.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316864  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0003  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 330 bp  63.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0285718 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  85.42 
 
 		 373 bp  63.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rnpBVIMSS1309440  rnpB RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  97.22 
 
 		 390 bp  63.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rnpBVIMSS1309406  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  97.22 
 
 		 333 bp  63.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rnpBVIMSS1309424  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  97.22 
 
 		 398 bp  63.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  85.53 
 
 		 316 bp  63.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0048  RNA component of RNaseP  85.53 
 
 		 333 bp  63.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.231595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0055  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 354 bp  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264132  normal  0.793704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0074    95.45 
 
 		 352 bp  63.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.301827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0059  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 374 bp  61.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303106  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    94.87 
 
 		 295 bp  61.9  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  94.87 
 
 		 295 bp  61.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0022  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 369 bp  61.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00496302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0028  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 366 bp  61.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0061  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 418 bp  61.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0246154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  94.87 
 
 		 296 bp  61.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0015  RNA component of RNaseP  84.81 
 
 		 313 bp  61.9  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0681345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  94.87 
 
 		 294 bp  61.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  94.87 
 
 		 295 bp  61.9  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0043  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 305 bp  60  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0073  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 299 bp  60  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_R0055    88.89 
 
 		 320 bp  60  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rnpBVIMSS1309388  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  97.06 
 
 		 307 bp  60  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rnpBVIMSS1309394  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  97.06 
 
 		 309 bp  60  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.371519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0046  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 326 bp  60  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.770648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0081  RNA component of RNaseP  91.3 
 
 		 327 bp  60  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000487507  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0045  RNA component of RNaseP  86.59 
 
 		 312 bp  60  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0023    96.97 
 
 		 347 bp  58  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000569795  normal  0.573618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0071  RNA component of RNaseP  93.33 
 
 		 352 bp  58  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671798 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 294 bp  58  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0031  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 347 bp  58  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0068  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 350 bp  58  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000826287  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0023    96.97 
 
 		 347 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0085  RNA component of RNaseP  89.8 
 
 		 358 bp  58  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162846  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0006  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 347 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0741238  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0063  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 347 bp  58  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0056  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 335 bp  58  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.425167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0023  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 304 bp  58  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000192247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0022  RNaseP RNA  96.97 
 
 		 347 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00017502  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0127  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 304 bp  58  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0076  RNA component of RNaseP  93.33 
 
 		 352 bp  58  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0030  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 322 bp  58  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>