39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_R0026 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_R0026  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 326 bp  646    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0051  RNA component of RNaseP  81.67 
 
 		 345 bp  137  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384072  normal  0.735401 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0059  RNA component of RNaseP  83.18 
 
 		 343 bp  119  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0109691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0037  RNaseP RNA  84.73 
 
 		 347 bp  93.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0034  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 306 bp  65.9  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0036  rnpB RNA  97.3 
 
 		 337 bp  65.9  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407742  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0045  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 312 bp  63.9  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 326 bp  61.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 345 bp  61.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 328 bp  61.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15110  Bacterial RNase P class A  97.14 
 
 		 324 bp  61.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0048  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 333 bp  61.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.231595 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0025  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 184 bp  61.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0068  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 338 bp  61.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.400378  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0013  RNA_RNaseP_classA  97.06 
 
 		 313 bp  60  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.336548  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1382  Bacterial RNase P class A  97.06 
 
 		 312 bp  60  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0034  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 339 bp  60  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0035  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 334 bp  60  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12130  Bacterial RNase P class A  94.44 
 
 		 317 bp  56  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0161879  normal  0.0949657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  94.44 
 
 		 340 bp  56  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0039  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 341 bp  54  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0961177  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09520  Bacterial RNase P class A  94.29 
 
 		 325 bp  54  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546213  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4508  RNase P RNA component precursor RnpB  85.07 
 
 		 396 bp  54  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0038  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 354 bp  54  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0631532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 348 bp  54  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 316 bp  54  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 373 bp  48.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 308 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 326 bp  48.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  91.67 
 
 		 301 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0033  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 304 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256591  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0041  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 289 bp  46.1  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000296722  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0049  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 292 bp  46.1  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 353 bp  46.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 328 bp  46.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 356 bp  46.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0035  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 284 bp  46.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0054  rnpB RNA  100 
 
 		 298 bp  46.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0043    91.43 
 
 		 293 bp  46.1  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00678643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>