11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_R0041 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_R0041  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 289 bp  573  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000296722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0015  RNA component of RNaseP  83.54 
 
 		 313 bp  54  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0681345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0081  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 327 bp  52  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000487507  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_rnpB  RNase P RNA component  84.62 
 
 		 326 bp  50.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0035  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 363 bp  48.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.531572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0054  rnpB RNA  100 
 
 		 298 bp  48.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0056  RNase P class A  91.67 
 
 		 276 bp  48.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.441573  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0049  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 292 bp  48.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0043  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 213 bp  46.1  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000487494  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0026  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 326 bp  46.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 301 bp  46.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>