28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_R0056 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_R0056  RNase P class A  100 
 
 		 276 bp  547  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.441573  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0028  RNA component of RNaseP  88.98 
 
 		 270 bp  133  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0015  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 313 bp  65.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0681345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 332 bp  63.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0043  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 213 bp  63.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000487494  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    97.14 
 
 		 330 bp  61.9  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 328 bp  61.9  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0035  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 363 bp  61.9  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.531572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 323 bp  61.9  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0005  RNase P class A  82.17 
 
 		 280 bp  60  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0019  RNA component of RNaseP  94.59 
 
 		 297 bp  58  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000680683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0068  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 372 bp  56  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.415959  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0033  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 272 bp  56  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399314  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0034  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 284 bp  54  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    94.29 
 
 		 295 bp  54  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    94.29 
 
 		 358 bp  54  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0081  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 327 bp  52  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000487507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0003  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 315 bp  50.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0012  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 357 bp  50.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0736  Bacterial RNase P class A  93.94 
 
 		 288 bp  50.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1797  bacterial RNase P, class A  96.55 
 
 		 380 bp  50.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.848087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0053  RNase P  93.94 
 
 		 326 bp  50.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0012  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 356 bp  50.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0591334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0003  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 327 bp  50.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0016  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 329 bp  50.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  93.94 
 
 		 315 bp  50.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0005  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 280 bp  48.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.500328  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0041  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 289 bp  48.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000296722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>