106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0043 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0043  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 213 bp  422  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000487494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0019  RNA component of RNaseP  96.05 
 
 		 297 bp  127  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000680683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0015  RNA component of RNaseP  92.13 
 
 		 313 bp  121  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0681345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    90.79 
 
 		 295 bp  95.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0035  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 363 bp  87.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.531572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    89.47 
 
 		 358 bp  87.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  89.47 
 
 		 303 bp  87.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    88.16 
 
 		 303 bp  79.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0068  RNA component of RNaseP  86.84 
 
 		 372 bp  71.9  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.415959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0097  RNA component of RNaseP  86.84 
 
 		 346 bp  71.9  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 398 bp  69.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0056  RNase P class A  97.22 
 
 		 276 bp  63.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.441573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0033  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 272 bp  63.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399314  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  94.87 
 
 		 359 bp  61.9  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0014  RNaseP RNA  94.87 
 
 		 296 bp  61.9  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  94.87 
 
 		 298 bp  61.9  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  94.87 
 
 		 323 bp  61.9  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  94.87 
 
 		 302 bp  61.9  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 328 bp  61.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0076  RNA component of RNaseP  94.87 
 
 		 303 bp  61.9  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0013  RNA component of RNaseP  94.87 
 
 		 303 bp  61.9  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0003  RNA component of RNaseP  84.62 
 
 		 315 bp  60  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_DernpB1  sRNA  83.15 
 
 		 261 bp  58  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.573184  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0006  RNAse P  83.15 
 
 		 304 bp  58  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.161973  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0736  Bacterial RNase P class A  96.97 
 
 		 288 bp  58  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0081  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 327 bp  58  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000487507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 332 bp  58  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0073  RNA component of RNaseP  92.5 
 
 		 299 bp  56  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0028  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 270 bp  56  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  94.44 
 
 		 328 bp  56  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0017  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 307 bp  56  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316864  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0051  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 297 bp  54  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    94.29 
 
 		 330 bp  54  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0014  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 331 bp  54  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000221757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4302  RNase P class A  92.31 
 
 		 303 bp  54  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4778  RNase P, class A  92.31 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0093  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 303 bp  54  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963867  normal  0.310473 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4220  bacterial RNase P, class A  92.31 
 
 		 303 bp  54  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0014    92.31 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4977  Bacterial RNase P class A  92.31 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0059  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 343 bp  54  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0109691  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3508  Bacterial RNase P class A  92.31 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3544  Bacterial RNase P class A  92.31 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3439  Bacterial RNase P class A  92.31 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3436  Bacterial RNase P class A  92.31 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3605  Bacterial RNase P class A  92.31 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.976853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4435  Bacterial RNase P class A  92.31 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0846372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0083  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0014  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 303 bp  54  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 348 bp  54  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 332 bp  54  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0034  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 284 bp  54  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  94.12 
 
 		 315 bp  52  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0003  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 327 bp  52  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0012  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 357 bp  52  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0012  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 356 bp  52  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0591334 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0012  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 301 bp  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 309 bp  50.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0053  RNase P  93.94 
 
 		 326 bp  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 326 bp  48.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 301 bp  48.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0029  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 298 bp  48.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.538332  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0051  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 295 bp  48.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.90798  normal  0.258556 
 
 
-
 
NC_006368  lpps01    89.74 
 
 		 205 bp  46.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpls01    89.74 
 
 		 205 bp  46.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 328 bp  46.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0003  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 283 bp  46.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000142891  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0002  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 237 bp  46.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0585787 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0031  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 347 bp  46.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0024  RNA component of RNase P  83.54 
 
 		 349 bp  46.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.699982  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0068  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 350 bp  46.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000826287  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0004  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 281 bp  46.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000603454  normal  0.0636822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0006  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 347 bp  46.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0741238  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0023  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 304 bp  46.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000192247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0022  RNaseP RNA  93.55 
 
 		 347 bp  46.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00017502  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0025  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 184 bp  46.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0037  RNaseP RNA  91.43 
 
 		 347 bp  46.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0054  rnpB RNA  89.74 
 
 		 298 bp  46.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  89.74 
 
 		 295 bp  46.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 316 bp  46.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0063  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 347 bp  46.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  89.74 
 
 		 295 bp  46.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    89.74 
 
 		 295 bp  46.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0023    93.55 
 
 		 347 bp  46.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0020    89.74 
 
 		 296 bp  46.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0023    93.55 
 
 		 347 bp  46.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000569795  normal  0.573618 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0020    89.74 
 
 		 296 bp  46.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2566  hypothetical protein  93.55 
 
 		 966 bp  46.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000598494  normal  0.490219 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0009    93.55 
 
 		 350 bp  46.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000711209  normal  0.574363 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0013  RNA component of RNaseP  89.74 
 
 		 296 bp  46.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.297268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0053  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 347 bp  46.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0003  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 294 bp  46.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158613 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1257  hypothetical protein  89.74 
 
 		 369 bp  46.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000363203  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0216  sRNA  91.43 
 
 		 346 bp  46.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0217  Bacterial RNase P class A  91.43 
 
 		 294 bp  46.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  89.74 
 
 		 296 bp  46.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 345 bp  46.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 294 bp  46.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0041  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 289 bp  46.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000296722  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0010  RNA component of RNaseP  89.74 
 
 		 302 bp  46.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0305173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>