24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_R0033 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_R0033  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 272 bp  539  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399314  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0068  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 372 bp  73.8  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.415959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0035  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 363 bp  65.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.531572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0015  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 313 bp  65.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0681345  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0028  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 270 bp  65.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0019  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 297 bp  63.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000680683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0043  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 213 bp  63.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000487494  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    94.87 
 
 		 295 bp  61.9  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0056  RNase P class A  96.88 
 
 		 276 bp  56  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.441573  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0003  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 330 bp  54  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0285718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0081  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 327 bp  54  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000487507  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0736  Bacterial RNase P class A  94.29 
 
 		 288 bp  54  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rnpBVIMSS1309440  rnpB RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  92.31 
 
 		 390 bp  54  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rnpBVIMSS1309424  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  92.31 
 
 		 398 bp  54  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0005  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 280 bp  50.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.500328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0021  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 359 bp  50.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 328 bp  50.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 332 bp  50.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0005  RNase P class A  91.67 
 
 		 280 bp  48.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 323 bp  48.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    93.75 
 
 		 330 bp  48.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 398 bp  48.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0034  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 284 bp  48.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1797  bacterial RNase P, class A  100 
 
 		 380 bp  46.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.848087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>