28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_R0005 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_R0005  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 280 bp  555  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.500328  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0005  RNase P class A  97.5 
 
 		 280 bp  500  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4342  RNA component of RNase P  97.06 
 
 		 353 bp  60  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_R0055    97.06 
 
 		 320 bp  60  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0033  RNA component of RNaseP  94.59 
 
 		 391 bp  58  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.408233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 308 bp  58  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 356 bp  58  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 353 bp  58  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0033  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 304 bp  56  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256591  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 373 bp  56  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  85.71 
 
 		 348 bp  56  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0009  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 348 bp  56  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  96.88 
 
 		 301 bp  56  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 332 bp  54  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0027  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 285 bp  54  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0028  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 270 bp  54  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0031  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 346 bp  52  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    94.12 
 
 		 358 bp  52  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0019    94.12 
 
 		 348 bp  52  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0920457  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0017  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 332 bp  52  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312757  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0033  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 272 bp  50.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399314  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0056  RNase P class A  93.75 
 
 		 276 bp  48.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.441573  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 345 bp  48.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  84.52 
 
 		 294 bp  48.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 301 bp  48.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0068  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 372 bp  48.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.415959  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0030  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 353 bp  46.1  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2169  RNA component of RNase P  93.55 
 
 		 275 bp  46.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>