62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_R0009 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_R0009  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 348 bp  690    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_R0055    92.71 
 
 		 320 bp  127  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4342  RNA component of RNase P  93.41 
 
 		 353 bp  125  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0019    92.31 
 
 		 348 bp  117  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0920457  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0031  RNA component of RNaseP  91.21 
 
 		 346 bp  109  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0002  RNA component of RNaseP  86.96 
 
 		 346 bp  79.8  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.269548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA10  RNaseP  85.71 
 
 		 365 bp  69.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0017  RNA component of RNaseP  85.56 
 
 		 332 bp  67.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312757  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0032  RNA component of RNaseP  91.84 
 
 		 233 bp  65.9  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0027  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 285 bp  61.9  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 373 bp  60  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 353 bp  60  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 308 bp  60  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 356 bp  60  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0033  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 304 bp  60  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256591  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  100 
 
 		 301 bp  60  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0005  RNase P class A  96.88 
 
 		 280 bp  56  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0034  RNA component of RNaseP  94.44 
 
 		 333 bp  56  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0634985 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 332 bp  56  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0005  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 280 bp  56  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.500328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0007    96.77 
 
 		 344 bp  54  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.877668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0034  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 333 bp  54  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0944967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4508  RNase P RNA component precursor RnpB  96.77 
 
 		 396 bp  54  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0032  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 333 bp  54  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.148898 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1398  sRNA  96.77 
 
 		 422 bp  54  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0029  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 364 bp  54  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.830354  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4220  bacterial RNase P, class A  89.13 
 
 		 303 bp  52  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 301 bp  52  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0013  RNA component of RNaseP  89.13 
 
 		 303 bp  52  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0033  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 391 bp  52  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.408233  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4302  RNase P class A  89.13 
 
 		 303 bp  52  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0010  RNA component of RNaseP  89.13 
 
 		 302 bp  52  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.811892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0010  RNA component of RNaseP  89.13 
 
 		 317 bp  52  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0451963  hitchhiker  0.000582152 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0127  RNA component of RNaseP  89.13 
 
 		 304 bp  52  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0011  RNA component of RNaseP  89.13 
 
 		 299 bp  52  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609568 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0001  RNaseP RNA  96.67 
 
 		 361 bp  52  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 328 bp  50.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0053  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 347 bp  50.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3565  RNase P class A  93.94 
 
 		 350 bp  50.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0056  RNA component of RNaseP  83.15 
 
 		 335 bp  50.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.425167 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0052  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 120 bp  50.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0048  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 326 bp  50.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  0.777963 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0053  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 347 bp  50.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0035  RNaseP RNA  82.95 
 
 		 378 bp  48.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 298 bp  48.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 294 bp  48.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0006  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 347 bp  46.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0741238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0068  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 350 bp  46.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000826287  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0030  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 353 bp  46.1  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0031  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 347 bp  46.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0007  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 390 bp  46.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.390255  normal  0.448753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0055  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 354 bp  46.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264132  normal  0.793704 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_rnpB  RNase P RNA component  93.55 
 
 		 326 bp  46.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0051  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 345 bp  46.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384072  normal  0.735401 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0051  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 290 bp  46.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000411974  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0009    93.55 
 
 		 350 bp  46.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000711209  normal  0.574363 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0023  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 304 bp  46.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000192247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0023    93.55 
 
 		 347 bp  46.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000569795  normal  0.573618 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0023    93.55 
 
 		 347 bp  46.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0022  RNaseP RNA  93.55 
 
 		 347 bp  46.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00017502  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0063  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 347 bp  46.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2169  RNA component of RNase P  96.3 
 
 		 275 bp  46.1  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>