28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_R0001 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_R0001  RNaseP RNA  100 
 
 		 361 bp  716    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0032  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 333 bp  58  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.148898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4508  RNase P RNA component precursor RnpB  100 
 
 		 396 bp  58  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0034  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 333 bp  58  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0944967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0002  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 346 bp  58  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.269548 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1398  sRNA  100 
 
 		 422 bp  58  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0029  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 364 bp  58  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.830354  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0034  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 333 bp  58  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0634985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0033  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 391 bp  56  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.408233  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0009  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 348 bp  52  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4342  RNA component of RNase P  96.55 
 
 		 353 bp  50.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0007    96.55 
 
 		 344 bp  50.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.877668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0017  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 332 bp  50.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312757  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_R0055    96.55 
 
 		 320 bp  50.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0035  RNaseP RNA  96.55 
 
 		 378 bp  50.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_rnpB  RNase P RNA component  96.55 
 
 		 326 bp  50.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0004  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 396 bp  48.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 356 bp  48.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 353 bp  48.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  96.43 
 
 		 301 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0067  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 382 bp  48.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0337579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 308 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0033  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 304 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256591  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 301 bp  48.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 373 bp  48.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0027  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 285 bp  48.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 332 bp  48.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0063  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 305 bp  46.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0344587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>