70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0027 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0027  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 285 bp  565  1.0000000000000001e-159  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  88.1 
 
 		 339 bp  71.9  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    83.78 
 
 		 303 bp  69.9  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  86.9 
 
 		 427 bp  63.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 301 bp  63.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0009  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 348 bp  61.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0029  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 298 bp  61.9  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.538332  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0007    100 
 
 		 344 bp  60  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.877668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 308 bp  60  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 353 bp  58  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0033  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 391 bp  58  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.408233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 356 bp  58  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_R0055    96.88 
 
 		 320 bp  56  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  96.88 
 
 		 301 bp  56  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0019  RNA component of RNaseP  82.95 
 
 		 297 bp  56  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000680683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 373 bp  56  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0033  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 304 bp  56  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256591  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4342  RNA component of RNase P  96.88 
 
 		 353 bp  56  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 323 bp  54  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0005  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 280 bp  54  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.500328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0019    94.29 
 
 		 348 bp  54  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0920457  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    96.77 
 
 		 330 bp  54  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0034  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 333 bp  54  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0634985 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0051  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 290 bp  54  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000411974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0005  RNase P class A  94.29 
 
 		 280 bp  54  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 332 bp  52  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0032  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 333 bp  52  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.148898 
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  83.33 
 
 		 315 bp  52  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0007  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 390 bp  52  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.390255  normal  0.448753 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0040  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 360 bp  52  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0034  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 333 bp  52  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0944967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4508  RNase P RNA component precursor RnpB  96.67 
 
 		 396 bp  52  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0012  RNA component of RNaseP  83.33 
 
 		 356 bp  52  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0591334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0002  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 346 bp  52  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.269548 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0029  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 364 bp  52  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.830354  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1398  sRNA  96.67 
 
 		 422 bp  52  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0031  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 346 bp  52  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 298 bp  50.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  100 
 
 		 359 bp  50.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0051  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 295 bp  50.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.90798  normal  0.258556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 309 bp  50.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0013  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 303 bp  50.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 348 bp  50.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0014  RNaseP RNA  100 
 
 		 296 bp  50.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384049  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0071  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 338 bp  50.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.202054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0076  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 303 bp  50.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 369 bp  50.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  100 
 
 		 302 bp  50.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  93.94 
 
 		 354 bp  50.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0017  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 332 bp  50.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312757  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0012  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 357 bp  50.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0003  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 294 bp  50.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158613 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0216  sRNA  100 
 
 		 346 bp  50.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0217  Bacterial RNase P class A  100 
 
 		 294 bp  50.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235788  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 326 bp  48.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 348 bp  48.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    93.75 
 
 		 295 bp  48.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0035  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 284 bp  48.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0016  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 329 bp  48.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0002  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 237 bp  48.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0585787 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0055  RNase P  93.75 
 
 		 338 bp  48.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0001  RNaseP RNA  96.43 
 
 		 361 bp  48.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12130  Bacterial RNase P class A  100 
 
 		 317 bp  48.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0161879  normal  0.0949657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  96.3 
 
 		 294 bp  46.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 303 bp  46.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0048  RNA component of RNaseP  89.74 
 
 		 326 bp  46.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  0.777963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0028  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 366 bp  46.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5661  RNaseP_bact_a  96.3 
 
 		 293 bp  46.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00231772  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WprnpB1  WprnpB1  93.55 
 
 		 292 bp  46.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 294 bp  46.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>