51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WprnpB1 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WprnpB1  WprnpB1  100 
 
 		 292 bp  579  1.0000000000000001e-163  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1157  sRNA  84.33 
 
 		 287 bp  97.6  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0036  RNA component of RNaseP  83.7 
 
 		 287 bp  83.8  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0035  RNA component of RNaseP  92.5 
 
 		 310 bp  56  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100496 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2222  bacterial RNase P, class A  96.88 
 
 		 292 bp  56  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 369 bp  54  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0046  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 326 bp  54  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.770648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  94.29 
 
 		 354 bp  54  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    94.29 
 
 		 295 bp  54  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0972  sRNA  92.31 
 
 		 292 bp  54  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 326 bp  52  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 301 bp  52  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0736  Bacterial RNase P class A  94.12 
 
 		 288 bp  52  0.00009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0019  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 297 bp  52  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000680683  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 305 bp  52  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0052  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 355 bp  52  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0014  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 342 bp  52  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    94.12 
 
 		 303 bp  52  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  94.12 
 
 		 302 bp  52  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0007    94.12 
 
 		 344 bp  52  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.877668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5661  RNaseP_bact_a  93.94 
 
 		 293 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00231772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  93.94 
 
 		 359 bp  50.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 295 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    93.94 
 
 		 295 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0049  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 292 bp  50.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1398  sRNA  100 
 
 		 422 bp  50.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0003  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 294 bp  50.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158613 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0216  sRNA  93.94 
 
 		 346 bp  50.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 295 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0217  Bacterial RNase P class A  93.94 
 
 		 294 bp  50.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  93.94 
 
 		 296 bp  50.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  93.94 
 
 		 294 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA62  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 292 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0049  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 386 bp  50.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.653302  normal  0.250597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R74  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 291 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0022  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 369 bp  50.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00496302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0034  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 284 bp  48.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0007  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 390 bp  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.390255  normal  0.448753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0059  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 374 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA10  RNaseP  93.75 
 
 		 365 bp  48.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0061  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 418 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0246154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0028  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 366 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0040  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 360 bp  46.1  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0146  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 298 bp  46.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0972194  hitchhiker  0.00000000182865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0003  RNase P  100 
 
 		 331 bp  46.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0021  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 359 bp  46.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0033  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 304 bp  46.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    91.43 
 
 		 330 bp  46.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpls01    91.43 
 
 		 205 bp  46.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0027  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 285 bp  46.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpps01    91.43 
 
 		 205 bp  46.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>