88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0046 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0046  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 326 bp  646    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.770648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0036  RNA component of RNaseP  84.19 
 
 		 312 bp  165  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.792422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0035  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 310 bp  161  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0021  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 359 bp  149  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0052  RNA component of RNaseP  83.19 
 
 		 326 bp  149  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0041  RNA component of RNaseP  95.56 
 
 		 329 bp  147  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0005  RNA component of RNaseP  95.56 
 
 		 381 bp  147  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.328274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0035  RNA component of RNaseP  82.92 
 
 		 326 bp  145  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rnpBVIMSS1309424  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  91.76 
 
 		 398 bp  113  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0003  RNA component of RNaseP  93.15 
 
 		 330 bp  105  8e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0285718 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rnpBVIMSS1309440  rnpB RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  83.85 
 
 		 390 bp  99.6  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0025  RNA component of RNaseP  92.42 
 
 		 332 bp  91.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rnpBVIMSS1309406  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  92.42 
 
 		 333 bp  91.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rnpBVIMSS1309400  rnpB RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  85.56 
 
 		 309 bp  75.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.930283  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rnpBVIMSS1309394  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  84.44 
 
 		 309 bp  67.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.371519  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rnpBVIMSS1309388  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  84.44 
 
 		 307 bp  67.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  94.87 
 
 		 354 bp  61.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  93.02 
 
 		 398 bp  61.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 303 bp  60  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 369 bp  60  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0043  RNA component of RNaseP  83.33 
 
 		 305 bp  60  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  94.59 
 
 		 302 bp  58  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    94.44 
 
 		 303 bp  56  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 326 bp  54  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0014  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 342 bp  54  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0052  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 355 bp  54  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0972  sRNA  94.29 
 
 		 292 bp  54  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 305 bp  54  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WprnpB1  WprnpB1  94.29 
 
 		 292 bp  54  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0003  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 294 bp  50.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158613 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0049  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 292 bp  50.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    93.94 
 
 		 295 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 295 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  93.94 
 
 		 359 bp  50.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0216  sRNA  93.94 
 
 		 346 bp  50.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0217  Bacterial RNase P class A  93.94 
 
 		 294 bp  50.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  93.94 
 
 		 296 bp  50.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  90.24 
 
 		 294 bp  50.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0051  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 295 bp  50.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.90798  normal  0.258556 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00893  RNA component of RNase P  91.89 
 
 		 308 bp  50.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R74  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 291 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 318 bp  50.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 298 bp  50.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 295 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0022  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 369 bp  50.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00496302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 352 bp  50.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0049  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 386 bp  50.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.653302  normal  0.250597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA62  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 292 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    91.89 
 
 		 352 bp  50.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  93.94 
 
 		 294 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5661  RNaseP_bact_a  93.94 
 
 		 293 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00231772  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    91.67 
 
 		 358 bp  48.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 348 bp  48.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0061  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 418 bp  48.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0246154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA10  RNaseP  93.75 
 
 		 365 bp  48.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 339 bp  48.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 427 bp  48.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 309 bp  48.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0059  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 374 bp  48.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    91.67 
 
 		 295 bp  48.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0028  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 366 bp  48.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0076  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 303 bp  46.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0012  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0068  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 350 bp  46.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000826287  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0083  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0014  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 303 bp  46.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0031  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 347 bp  46.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3436  Bacterial RNase P class A  91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0013  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 303 bp  46.1  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0009    91.43 
 
 		 350 bp  46.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000711209  normal  0.574363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4302  RNase P class A  91.43 
 
 		 303 bp  46.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4778  RNase P, class A  91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0093  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 303 bp  46.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963867  normal  0.310473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0063  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 347 bp  46.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4220  bacterial RNase P, class A  91.43 
 
 		 303 bp  46.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0063  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 305 bp  46.1  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0344587 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0014    91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0023    91.43 
 
 		 347 bp  46.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0023    91.43 
 
 		 347 bp  46.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000569795  normal  0.573618 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0006  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 347 bp  46.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0741238  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0022  RNaseP RNA  91.43 
 
 		 347 bp  46.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00017502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4977  Bacterial RNase P class A  91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0023  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 304 bp  46.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000192247  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3508  Bacterial RNase P class A  91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3544  Bacterial RNase P class A  91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3439  Bacterial RNase P class A  91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3605  Bacterial RNase P class A  91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.976853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4435  Bacterial RNase P class A  91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0846372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>