202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0043 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0043    100 
 
 		 303 bp  601  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    85.87 
 
 		 295 bp  151  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    95.56 
 
 		 358 bp  147  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0019  RNA component of RNaseP  83.33 
 
 		 297 bp  135  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000680683  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  83.25 
 
 		 303 bp  131  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0068  RNA component of RNaseP  91.95 
 
 		 372 bp  117  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.415959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0035  RNA component of RNaseP  89.66 
 
 		 363 bp  101  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.531572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_DernpB1  sRNA  82.11 
 
 		 261 bp  93.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.573184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  88.51 
 
 		 398 bp  93.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  90.7 
 
 		 348 bp  91.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  91.46 
 
 		 332 bp  91.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  91.36 
 
 		 427 bp  89.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  91.36 
 
 		 309 bp  89.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0017  RNA component of RNaseP  85.07 
 
 		 307 bp  87.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316864  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0006  RNAse P  81.58 
 
 		 304 bp  85.7  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.161973  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  88.17 
 
 		 326 bp  81.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0043  RNA component of RNaseP  88.16 
 
 		 213 bp  79.8  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000487494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0003  RNA component of RNaseP  88.16 
 
 		 315 bp  79.8  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  86.02 
 
 		 296 bp  75.8  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  85.47 
 
 		 301 bp  75.8  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA62  RNA component of RNaseP  85.87 
 
 		 292 bp  73.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 328 bp  73.8  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0073  RNA component of RNaseP  88.04 
 
 		 299 bp  73.8  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0048  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 333 bp  73.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.231595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 328 bp  73.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  85.87 
 
 		 295 bp  73.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    85.87 
 
 		 295 bp  73.8  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  88.24 
 
 		 316 bp  73.8  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 339 bp  73.8  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 369 bp  71.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  100 
 
 		 354 bp  71.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0053  RNase P  86.84 
 
 		 326 bp  71.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0027  RNA component of RNaseP  83.78 
 
 		 285 bp  69.9  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0015  RNA component of RNaseP  85.06 
 
 		 313 bp  69.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0681345  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  86.32 
 
 		 326 bp  69.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  87.1 
 
 		 298 bp  67.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  97.37 
 
 		 295 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0081  RNA component of RNaseP  92 
 
 		 327 bp  67.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000487507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  97.37 
 
 		 294 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  100 
 
 		 359 bp  65.9  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5661  RNaseP_bact_a  100 
 
 		 293 bp  65.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00231772  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 305 bp  65.9  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0035  RNA component of RNaseP  85.39 
 
 		 334 bp  65.9  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0049  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 386 bp  65.9  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.653302  normal  0.250597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0005  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 381 bp  65.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.328274 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0216  sRNA  100 
 
 		 346 bp  65.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R74  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 291 bp  65.9  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0012  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 356 bp  65.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0591334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0012  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 357 bp  65.9  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0003  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0022  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 369 bp  65.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00496302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0972  sRNA  100 
 
 		 292 bp  65.9  0.000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0052  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 355 bp  65.9  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0014  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 342 bp  65.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  100 
 
 		 302 bp  65.9  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0217  Bacterial RNase P class A  100 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0041  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 329 bp  65.9  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  85.53 
 
 		 315 bp  63.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0016  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 329 bp  63.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    95 
 
 		 330 bp  63.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0035  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 310 bp  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0028  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 366 bp  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0061  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 418 bp  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0246154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 318 bp  63.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0021  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 359 bp  63.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 352 bp  63.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0059  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 374 bp  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303106  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    97.22 
 
 		 352 bp  63.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA10  RNaseP  100 
 
 		 365 bp  63.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  85.53 
 
 		 328 bp  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0052  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 326 bp  61.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0035  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 326 bp  61.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  91.49 
 
 		 323 bp  61.9  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0010  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 312 bp  60  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0227621  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0013  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 291 bp  60  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0025  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 298 bp  60  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0014  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 331 bp  60  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000221757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0137  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 300 bp  60  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0019  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 300 bp  60  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0017  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 300 bp  60  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.585767  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0137  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 300 bp  60  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0025  RNA component of RNaseP  87.93 
 
 		 184 bp  60  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0126    97.06 
 
 		 298 bp  60  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 294 bp  60  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0013  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 306 bp  60  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0055  RNase P  100 
 
 		 338 bp  60  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0146  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 299 bp  60  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0134  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 298 bp  60  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0051  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 295 bp  60  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.90798  normal  0.258556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0035  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 284 bp  60  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0020    96.97 
 
 		 296 bp  58  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpps01    96.97 
 
 		 205 bp  58  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0024  RNA component of RNase P  96.97 
 
 		 349 bp  58  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.699982  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0009    96.97 
 
 		 350 bp  58  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000711209  normal  0.574363 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0023  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 304 bp  58  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000192247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0022  RNaseP RNA  96.97 
 
 		 347 bp  58  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00017502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4220  bacterial RNase P, class A  96.97 
 
 		 303 bp  58  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0127  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 304 bp  58  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0063  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 305 bp  58  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0344587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0063  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 347 bp  58  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>