173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0067 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 398 bp  789    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  85.35 
 
 		 303 bp  161  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    92.05 
 
 		 358 bp  119  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  84.4 
 
 		 298 bp  97.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0012  RNA component of RNaseP  90.79 
 
 		 356 bp  95.6  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0591334 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    88.51 
 
 		 303 bp  93.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0019  RNA component of RNaseP  85.04 
 
 		 297 bp  93.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000680683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4508  RNase P RNA component precursor RnpB  95.16 
 
 		 396 bp  91.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0012  RNA component of RNaseP  89.47 
 
 		 357 bp  87.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0032  RNA component of RNaseP  96.08 
 
 		 333 bp  85.7  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.148898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0034  RNA component of RNaseP  96.08 
 
 		 333 bp  85.7  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0944967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rnpBVIMSS1309440  rnpB RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  89.04 
 
 		 390 bp  81.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  88.16 
 
 		 315 bp  79.8  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0003  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 330 bp  79.8  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0285718 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rnpBVIMSS1309424  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  88.89 
 
 		 398 bp  79.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0025  RNA component of RNaseP  89.55 
 
 		 332 bp  77.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rnpBVIMSS1309406  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  89.55 
 
 		 333 bp  77.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  88.24 
 
 		 294 bp  73.8  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  87.64 
 
 		 354 bp  73.8  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0034  RNA component of RNaseP  91.8 
 
 		 333 bp  73.8  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0634985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0035  RNA component of RNaseP  95.45 
 
 		 363 bp  71.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.531572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  88.1 
 
 		 318 bp  71.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0041  RNA component of RNaseP  89.06 
 
 		 329 bp  71.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  88.1 
 
 		 352 bp  71.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    88.1 
 
 		 352 bp  71.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  86.08 
 
 		 359 bp  69.9  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  85.26 
 
 		 302 bp  69.9  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  86.81 
 
 		 356 bp  69.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0043  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 213 bp  69.9  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000487494  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0036  RNA component of RNaseP  95.24 
 
 		 312 bp  67.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.792422 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  93.48 
 
 		 328 bp  67.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0097  RNA component of RNaseP  93.48 
 
 		 346 bp  67.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0043  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 305 bp  65.9  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0022  RNA component of RNaseP  91.84 
 
 		 369 bp  65.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00496302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0028  RNA component of RNaseP  91.84 
 
 		 366 bp  65.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0061  RNA component of RNaseP  91.84 
 
 		 418 bp  65.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0246154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0021  RNA component of RNaseP  95.12 
 
 		 359 bp  65.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rnpBVIMSS1309388  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  97.3 
 
 		 307 bp  65.9  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rnpBVIMSS1309394  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  97.3 
 
 		 309 bp  65.9  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.371519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0059  RNA component of RNaseP  91.84 
 
 		 374 bp  65.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  87.21 
 
 		 348 bp  65.9  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  86.52 
 
 		 353 bp  65.9  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0005  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 381 bp  63.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.328274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0035  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 310 bp  63.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  86.9 
 
 		 369 bp  63.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0052  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 326 bp  61.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  94.87 
 
 		 296 bp  61.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0046  RNA component of RNaseP  93.02 
 
 		 326 bp  61.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.770648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0039    90.2 
 
 		 363 bp  61.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0068  RNA component of RNaseP  83.52 
 
 		 372 bp  61.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.415959  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0048  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 326 bp  61.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  0.777963 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0015  RNA component of RNaseP  84.81 
 
 		 313 bp  61.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0681345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3565  RNase P class A  97.14 
 
 		 350 bp  61.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  94.87 
 
 		 294 bp  61.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  94.87 
 
 		 295 bp  61.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 316 bp  61.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0056  RNA component of RNaseP  86.08 
 
 		 335 bp  61.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.425167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  94.87 
 
 		 295 bp  61.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    94.87 
 
 		 295 bp  61.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0035  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 326 bp  61.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0073  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 299 bp  60  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  87.18 
 
 		 427 bp  60  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0051  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 295 bp  60  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.90798  normal  0.258556 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  85.56 
 
 		 373 bp  60  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0074    88.71 
 
 		 352 bp  60  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.301827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 326 bp  60  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0012  RNA component of RNaseP  92.68 
 
 		 301 bp  58  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0013  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 303 bp  58  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0049  RNA component of RNaseP  89.8 
 
 		 386 bp  58  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.653302  normal  0.250597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0052  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 120 bp  58  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 309 bp  58  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0052  RNA component of RNaseP  89.8 
 
 		 355 bp  58  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0017  RNA component of RNaseP  92.68 
 
 		 307 bp  58  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316864  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0014  RNaseP RNA  96.97 
 
 		 296 bp  58  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  92.68 
 
 		 323 bp  58  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0053  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 347 bp  58  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08950  Bacterial RNase P class A  86.15 
 
 		 306 bp  58  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rnpBVIMSS1309400  rnpB RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  94.59 
 
 		 309 bp  58  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.930283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA10  RNaseP  89.8 
 
 		 365 bp  58  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0053  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 347 bp  58  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 332 bp  58  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 339 bp  58  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0076  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 303 bp  58  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0053  RNase P  84.21 
 
 		 326 bp  56  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    96.88 
 
 		 295 bp  56  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0216  sRNA  89.58 
 
 		 346 bp  56  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA62  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 292 bp  54  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 328 bp  54  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R74  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 291 bp  54  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0068  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 350 bp  54  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000826287  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0009    94.29 
 
 		 350 bp  54  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000711209  normal  0.574363 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0020    82.76 
 
 		 296 bp  54  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0023  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 304 bp  54  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000192247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0022  RNaseP RNA  94.29 
 
 		 347 bp  54  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00017502  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0127  RNA component of RNaseP  90.7 
 
 		 304 bp  54  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0055  RNA component of RNaseP  84.81 
 
 		 354 bp  54  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264132  normal  0.793704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0059  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 343 bp  54  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0109691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0063  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 347 bp  54  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 328 bp  54  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0023    94.29 
 
 		 347 bp  54  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>