137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_R0036 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_R0036  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 312 bp  618  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.792422 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0003  RNA component of RNaseP  92.19 
 
 		 330 bp  262  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0285718 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rnpBVIMSS1309424  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  88.12 
 
 		 398 bp  220  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rnpBVIMSS1309440  rnpB RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  86.67 
 
 		 390 bp  176  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0046  RNA component of RNaseP  84.19 
 
 		 326 bp  165  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.770648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0052  RNA component of RNaseP  84.32 
 
 		 326 bp  153  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0035  RNA component of RNaseP  84.03 
 
 		 326 bp  149  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rnpBVIMSS1309394  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  85.42 
 
 		 309 bp  147  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.371519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0035  RNA component of RNaseP  83.04 
 
 		 310 bp  147  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100496 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0043  RNA component of RNaseP  85.42 
 
 		 305 bp  141  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rnpBVIMSS1309388  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  85.42 
 
 		 307 bp  141  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rnpBVIMSS1309400  rnpB RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  84.9 
 
 		 309 bp  139  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.930283  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0041  RNA component of RNaseP  90.35 
 
 		 329 bp  131  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0005  RNA component of RNaseP  89.83 
 
 		 381 bp  131  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.328274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0021  RNA component of RNaseP  91.11 
 
 		 359 bp  115  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0025  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 332 bp  99.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rnpBVIMSS1309406  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  88.89 
 
 		 333 bp  99.6  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00893  RNA component of RNase P  97.44 
 
 		 308 bp  69.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  88.31 
 
 		 298 bp  67.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  95.24 
 
 		 398 bp  67.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 303 bp  65.9  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  87.34 
 
 		 302 bp  63.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  93.18 
 
 		 354 bp  63.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0012  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0076  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 303 bp  61.9  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3439  Bacterial RNase P class A  97.14 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3605  Bacterial RNase P class A  97.14 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.976853 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0083  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481467  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0063  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 305 bp  61.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0344587 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3436  Bacterial RNase P class A  97.14 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3544  Bacterial RNase P class A  97.14 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4302  RNase P class A  97.14 
 
 		 303 bp  61.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4778  RNase P, class A  97.14 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0093  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 303 bp  61.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963867  normal  0.310473 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4220  bacterial RNase P, class A  97.14 
 
 		 303 bp  61.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0014    97.14 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0013  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 303 bp  61.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0014  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 303 bp  61.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4977  Bacterial RNase P class A  97.14 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4435  Bacterial RNase P class A  97.14 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0846372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3508  Bacterial RNase P class A  97.14 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 369 bp  60  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0010  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 317 bp  60  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0451963  hitchhiker  0.000582152 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0146  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 298 bp  60  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0972194  hitchhiker  0.00000000182865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0024  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 298 bp  60  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0063  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 359 bp  58  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0010  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 302 bp  58  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.811892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0010  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 312 bp  58  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0227621  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0024  RNA component of RNase P  96.97 
 
 		 349 bp  58  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.699982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0006  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 305 bp  58  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0014  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 331 bp  58  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000221757  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0073  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 299 bp  58  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0011  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 299 bp  58  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  94.59 
 
 		 318 bp  58  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0014  RNaseP RNA  96.97 
 
 		 296 bp  58  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0137  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 300 bp  58  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0019  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 300 bp  58  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0017  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 300 bp  58  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.585767  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0137  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 300 bp  58  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  94.59 
 
 		 352 bp  58  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0126    96.97 
 
 		 298 bp  58  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    94.59 
 
 		 352 bp  58  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0013  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 306 bp  58  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0120  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 298 bp  58  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0025  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 298 bp  58  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0134  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 298 bp  58  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0030  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 322 bp  58  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0146  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 299 bp  58  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0013  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 291 bp  58  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0017  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 307 bp  58  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316864  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  94.44 
 
 		 427 bp  56  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  94.44 
 
 		 309 bp  56  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  94.44 
 
 		 348 bp  56  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    94.44 
 
 		 358 bp  56  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  92.5 
 
 		 294 bp  56  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    94.44 
 
 		 303 bp  56  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  94.44 
 
 		 339 bp  56  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0051  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 295 bp  54  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.90798  normal  0.258556 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0031  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 347 bp  54  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0972  sRNA  94.29 
 
 		 292 bp  54  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0068  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 350 bp  54  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000826287  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0052  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 355 bp  54  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0014  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 342 bp  54  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0006  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 347 bp  54  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0741238  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0023  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 304 bp  54  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000192247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0022  RNaseP RNA  94.29 
 
 		 347 bp  54  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00017502  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 326 bp  54  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0063  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 347 bp  54  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 305 bp  54  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0023    94.29 
 
 		 347 bp  54  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0023    94.29 
 
 		 347 bp  54  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000569795  normal  0.573618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0009    94.29 
 
 		 350 bp  54  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000711209  normal  0.574363 
 
 
-
 
NC_006368  lpps01    94.12 
 
 		 205 bp  52  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpls01    94.12 
 
 		 205 bp  52  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0056  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 335 bp  52  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.425167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0071  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 352 bp  52  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0076  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 352 bp  52  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0039    94.12 
 
 		 363 bp  52  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0055  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 354 bp  50.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264132  normal  0.793704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  93.94 
 
 		 294 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>