95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_R0043 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_R0043  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 305 bp  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rnpBVIMSS1309388  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  97.38 
 
 		 307 bp  541  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rnpBVIMSS1309400  rnpB RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  96.09 
 
 		 309 bp  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.930283  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rnpBVIMSS1309394  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  94.46 
 
 		 309 bp  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.371519  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0025  RNA component of RNaseP  83.74 
 
 		 332 bp  153  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rnpBVIMSS1309406  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  83.74 
 
 		 333 bp  153  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0036  RNA component of RNaseP  85.42 
 
 		 312 bp  141  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.792422 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rnpBVIMSS1309440  rnpB RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  83.67 
 
 		 390 bp  133  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0003  RNA component of RNaseP  83.94 
 
 		 330 bp  129  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0285718 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rnpBVIMSS1309424  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  90 
 
 		 398 bp  107  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0041  RNA component of RNaseP  87.95 
 
 		 329 bp  85.7  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0052  RNA component of RNaseP  88.46 
 
 		 326 bp  83.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0035  RNA component of RNaseP  88.46 
 
 		 326 bp  83.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0005  RNA component of RNaseP  87.34 
 
 		 381 bp  77.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.328274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0021  RNA component of RNaseP  85.56 
 
 		 359 bp  75.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0035  RNA component of RNaseP  85.9 
 
 		 310 bp  67.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100496 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 398 bp  65.9  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0046  RNA component of RNaseP  83.33 
 
 		 326 bp  60  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.770648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  94.44 
 
 		 294 bp  56  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0017  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 300 bp  54  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.585767  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0014  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 331 bp  54  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000221757  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3544  Bacterial RNase P class A  96.67 
 
 		 301 bp  52  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4778  RNase P, class A  96.67 
 
 		 301 bp  52  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0146  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 298 bp  52  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0972194  hitchhiker  0.00000000182865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0093  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 303 bp  52  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963867  normal  0.310473 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0024  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 298 bp  52  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0017  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 307 bp  52  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316864  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0146  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 299 bp  52  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4220  bacterial RNase P, class A  96.67 
 
 		 303 bp  52  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0014    96.67 
 
 		 301 bp  52  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0013  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 291 bp  52  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4977  Bacterial RNase P class A  96.67 
 
 		 301 bp  52  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0013  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 303 bp  52  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3508  Bacterial RNase P class A  96.67 
 
 		 301 bp  52  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0053  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 347 bp  52  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3439  Bacterial RNase P class A  96.67 
 
 		 301 bp  52  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0014  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 303 bp  52  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0083  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 301 bp  52  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481467  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0076  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 303 bp  52  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0053  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 347 bp  52  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3436  Bacterial RNase P class A  96.67 
 
 		 301 bp  52  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3605  Bacterial RNase P class A  96.67 
 
 		 301 bp  52  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.976853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4435  Bacterial RNase P class A  96.67 
 
 		 301 bp  52  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0846372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0025  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 298 bp  52  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00893  RNA component of RNase P  96.67 
 
 		 308 bp  52  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0063  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 359 bp  52  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0014  RNaseP RNA  96.67 
 
 		 296 bp  52  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384049  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    94.12 
 
 		 352 bp  52  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0126    96.67 
 
 		 298 bp  52  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 369 bp  52  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0063  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 305 bp  52  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0344587 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0012  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 301 bp  52  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0137  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 300 bp  52  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0019  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 300 bp  52  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0137  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 300 bp  52  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 352 bp  52  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 318 bp  52  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0011  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 299 bp  52  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0073  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 299 bp  52  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0006  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 305 bp  52  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0052  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 120 bp  52  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0024  RNA component of RNase P  96.67 
 
 		 349 bp  52  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.699982  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0010  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 312 bp  52  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0227621  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0010  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 302 bp  52  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.811892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0010  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 317 bp  52  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0451963  hitchhiker  0.000582152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0030  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 322 bp  52  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4302  RNase P class A  96.67 
 
 		 303 bp  52  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 328 bp  52  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0134  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 298 bp  52  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0120  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 298 bp  52  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  94.12 
 
 		 354 bp  52  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0013  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 306 bp  52  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321462 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3565  RNase P class A  93.94 
 
 		 350 bp  50.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0023    96.55 
 
 		 341 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0216677 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 339 bp  50.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0051  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 295 bp  50.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.90798  normal  0.258556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0035  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 284 bp  50.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 427 bp  50.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    93.94 
 
 		 303 bp  50.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0085  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 358 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162846  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 309 bp  50.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0070  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 357 bp  50.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 348 bp  50.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0074    96.55 
 
 		 352 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.301827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0055  RNase P  93.94 
 
 		 338 bp  50.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0076  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 352 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0071  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 352 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671798 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    93.94 
 
 		 358 bp  50.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0048  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 326 bp  50.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  0.777963 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 326 bp  48.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0004  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 396 bp  48.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08950  Bacterial RNase P class A  100 
 
 		 306 bp  46.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0035  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 363 bp  46.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.531572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0025  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 368 bp  46.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>