34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08950 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08950  Bacterial RNase P class A  100 
 
 		 306 bp  607  9.999999999999999e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0043  RNA component of RNaseP  88.46 
 
 		 312 bp  111  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.282999  hitchhiker  0.0000000823282 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0029  RNA component of RNaseP  83.08 
 
 		 298 bp  101  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.538332  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09390  Bacterial RNase P class A  85.44 
 
 		 313 bp  85.7  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.282783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  88.57 
 
 		 369 bp  69.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  88.73 
 
 		 332 bp  61.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  87.14 
 
 		 354 bp  61.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  86.15 
 
 		 398 bp  58  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0010  RNA component of RNaseP  90.48 
 
 		 312 bp  52  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0227621  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0025  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 332 bp  50.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    85.29 
 
 		 352 bp  50.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rnpBVIMSS1309440  rnpB RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  100 
 
 		 390 bp  50.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0052  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 326 bp  50.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0035  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 310 bp  50.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100496 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0035  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 326 bp  50.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  84.62 
 
 		 303 bp  50.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0041  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 329 bp  50.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rnpBVIMSS1309406  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  100 
 
 		 333 bp  50.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0005  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 381 bp  50.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.328274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0051  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 297 bp  50.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0003  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 330 bp  50.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0285718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  85.29 
 
 		 318 bp  50.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0021  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 359 bp  50.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  85.29 
 
 		 352 bp  50.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rnpBVIMSS1309424  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  100 
 
 		 398 bp  50.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    100 
 
 		 303 bp  48.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    93.75 
 
 		 330 bp  48.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rnpBVIMSS1309388  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  100 
 
 		 307 bp  46.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0067  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 382 bp  46.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0337579  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0036  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 312 bp  46.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.792422 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0043  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 305 bp  46.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rnpBVIMSS1309394  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  100 
 
 		 309 bp  46.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.371519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 326 bp  46.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0002  RNA component of RNaseP  91.49 
 
 		 237 bp  46.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0585787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>