107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0043 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0043  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 312 bp  618  1e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.282999  hitchhiker  0.0000000823282 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09390  Bacterial RNase P class A  85.64 
 
 		 313 bp  151  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.282783 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08950  Bacterial RNase P class A  88.46 
 
 		 306 bp  111  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0029  RNA component of RNaseP  90.8 
 
 		 298 bp  109  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.538332  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  92.11 
 
 		 332 bp  103  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0013  RNA component of RNaseP  91.03 
 
 		 296 bp  99.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.297268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0051  RNA component of RNaseP  89.87 
 
 		 295 bp  93.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.90798  normal  0.258556 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  88.61 
 
 		 359 bp  85.7  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  88.61 
 
 		 295 bp  85.7  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    88.61 
 
 		 295 bp  85.7  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0010  RNA component of RNaseP  88.61 
 
 		 302 bp  85.7  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0305173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  88.61 
 
 		 296 bp  85.7  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0073  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 299 bp  83.8  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0054  rnpB RNA  88.46 
 
 		 298 bp  83.8  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0020    88.46 
 
 		 296 bp  83.8  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0020    88.46 
 
 		 296 bp  83.8  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  87.34 
 
 		 298 bp  77.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  87.34 
 
 		 302 bp  77.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  87.34 
 
 		 295 bp  77.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0003  RNA component of RNaseP  87.34 
 
 		 294 bp  77.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158613 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0216  sRNA  87.34 
 
 		 346 bp  77.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0217  Bacterial RNase P class A  87.34 
 
 		 294 bp  77.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235788  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  90.32 
 
 		 305 bp  75.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0010  RNA component of RNaseP  86.84 
 
 		 317 bp  71.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0451963  hitchhiker  0.000582152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5661  RNaseP_bact_a  86.08 
 
 		 293 bp  69.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00231772  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpps01    86.08 
 
 		 205 bp  69.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpls01    86.08 
 
 		 205 bp  69.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0051  RNA component of RNaseP  86.08 
 
 		 297 bp  69.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA62  RNA component of RNaseP  85.9 
 
 		 292 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0010  RNA component of RNaseP  87.14 
 
 		 312 bp  67.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0227621  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0006  RNA component of RNaseP  87.14 
 
 		 305 bp  67.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R74  RNA component of RNaseP  85.71 
 
 		 291 bp  65.9  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0010  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 302 bp  63.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.811892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0011  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 299 bp  63.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  86.75 
 
 		 328 bp  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0053  RNA component of RNaseP  85.53 
 
 		 347 bp  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0053  RNA component of RNaseP  85.53 
 
 		 347 bp  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0012  RNA component of RNaseP  91.49 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0016  RNA component of RNaseP  91.49 
 
 		 329 bp  61.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 339 bp  61.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  84.81 
 
 		 294 bp  61.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4302  RNase P class A  91.49 
 
 		 303 bp  61.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4778  RNase P, class A  91.49 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0093  RNA component of RNaseP  91.49 
 
 		 303 bp  61.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963867  normal  0.310473 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4220  bacterial RNase P, class A  91.49 
 
 		 303 bp  61.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0014    91.49 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4977  Bacterial RNase P class A  91.49 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3508  Bacterial RNase P class A  91.49 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3544  Bacterial RNase P class A  91.49 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3439  Bacterial RNase P class A  91.49 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3436  Bacterial RNase P class A  91.49 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3605  Bacterial RNase P class A  91.49 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.976853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4435  Bacterial RNase P class A  91.49 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0846372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0083  RNA component of RNaseP  91.49 
 
 		 301 bp  61.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0014  RNA component of RNaseP  91.49 
 
 		 303 bp  61.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 309 bp  60  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0014  RNA component of RNaseP  87.1 
 
 		 331 bp  60  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000221757  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0025  RNA component of RNaseP  91.3 
 
 		 368 bp  60  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0014  RNaseP RNA  90 
 
 		 296 bp  60  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0127  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 304 bp  60  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 348 bp  60  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2222  bacterial RNase P, class A  84.62 
 
 		 292 bp  60  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 427 bp  58  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 294 bp  58  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 318 bp  56  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 352 bp  56  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    100 
 
 		 352 bp  56  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0146  RNA component of RNaseP  84.21 
 
 		 299 bp  56  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0081  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 327 bp  56  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000487507  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0002  RNA component of RNaseP  90.7 
 
 		 237 bp  54  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0585787 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0052  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 120 bp  54  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0059  RNA component of RNaseP  90.7 
 
 		 251 bp  54  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00893  RNA component of RNase P  89.36 
 
 		 308 bp  54  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0013  RNA component of RNaseP  89.36 
 
 		 303 bp  54  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0076  RNA component of RNaseP  89.36 
 
 		 303 bp  54  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0053  RNase P  100 
 
 		 326 bp  52  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0055  RNase P  88 
 
 		 338 bp  52  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    100 
 
 		 358 bp  52  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0003  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 315 bp  52  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0031  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 347 bp  50.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0068  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 350 bp  50.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000826287  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0006  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 347 bp  50.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0741238  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0048  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 326 bp  50.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  0.777963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0023  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 304 bp  50.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000192247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0022  RNaseP RNA  100 
 
 		 347 bp  50.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00017502  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3565  RNase P class A  100 
 
 		 350 bp  50.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0063  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 347 bp  50.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0023    100 
 
 		 347 bp  50.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0023    100 
 
 		 347 bp  50.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000569795  normal  0.573618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0009    100 
 
 		 350 bp  50.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000711209  normal  0.574363 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    96.55 
 
 		 303 bp  50.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0055  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 354 bp  50.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264132  normal  0.793704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0056  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 335 bp  50.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.425167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 398 bp  50.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 303 bp  50.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0061  RNA component of RNaseP  87.5 
 
 		 418 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0246154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0137  RNA component of RNaseP  82.89 
 
 		 300 bp  48.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 369 bp  48.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  96.43 
 
 		 354 bp  48.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0134  RNA component of RNaseP  82.89 
 
 		 298 bp  48.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>