68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_R0059 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_R0059  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 251 bp  498  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0002  RNA component of RNaseP  95.12 
 
 		 237 bp  131  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0585787 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  90.54 
 
 		 302 bp  91.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0016  RNA component of RNaseP  84.26 
 
 		 329 bp  79.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0025  RNA component of RNaseP  87.8 
 
 		 298 bp  75.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0146  RNA component of RNaseP  87.8 
 
 		 299 bp  75.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0134  RNA component of RNaseP  87.8 
 
 		 298 bp  75.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0126    87.8 
 
 		 298 bp  75.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0067  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 382 bp  71.9  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0337579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0002  RNA component of RNaseP  85.54 
 
 		 276 bp  69.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00285057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0066  Bacterial RNase P  85.54 
 
 		 276 bp  69.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00243205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0120  RNA component of RNaseP  86.59 
 
 		 298 bp  67.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0042  RNase P  85.37 
 
 		 253 bp  67.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446762  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0137  RNA component of RNaseP  86.59 
 
 		 300 bp  67.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0019  RNA component of RNaseP  86.59 
 
 		 300 bp  67.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0137  RNA component of RNaseP  86.59 
 
 		 300 bp  67.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0042    84.15 
 
 		 253 bp  60  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000208955  normal  0.577092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0010  RNA component of RNaseP  85.94 
 
 		 302 bp  56  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0305173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0127  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 304 bp  56  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0029  RNA component of RNaseP  90.91 
 
 		 298 bp  56  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.538332  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0043  RNA component of RNaseP  90.7 
 
 		 312 bp  54  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.282999  hitchhiker  0.0000000823282 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0014  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 303 bp  52  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0014    94.12 
 
 		 301 bp  52  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0012  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 301 bp  52  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0093  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 303 bp  52  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963867  normal  0.310473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3508  Bacterial RNase P class A  94.12 
 
 		 301 bp  52  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4778  RNase P, class A  94.12 
 
 		 301 bp  52  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0083  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 301 bp  52  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4977  Bacterial RNase P class A  94.12 
 
 		 301 bp  52  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0076  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 303 bp  52  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3544  Bacterial RNase P class A  94.12 
 
 		 301 bp  52  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3439  Bacterial RNase P class A  94.12 
 
 		 301 bp  52  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0013  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 303 bp  52  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3436  Bacterial RNase P class A  94.12 
 
 		 301 bp  52  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3605  Bacterial RNase P class A  94.12 
 
 		 301 bp  52  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.976853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4435  Bacterial RNase P class A  94.12 
 
 		 301 bp  52  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0846372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0004  RNA component of RNaseP  90.24 
 
 		 281 bp  50.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000603454  normal  0.0636822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4220  bacterial RNase P, class A  93.94 
 
 		 303 bp  50.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0003  RNA component of RNaseP  90.24 
 
 		 283 bp  50.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000142891  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4302  RNase P class A  93.94 
 
 		 303 bp  50.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    100 
 
 		 330 bp  50.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0003  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 315 bp  48.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0009    88.64 
 
 		 350 bp  48.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000711209  normal  0.574363 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0068  RNA component of RNaseP  88.64 
 
 		 350 bp  48.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000826287  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0023    88.64 
 
 		 347 bp  48.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000569795  normal  0.573618 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0023    88.64 
 
 		 347 bp  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0013  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 291 bp  48.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0063  RNA component of RNaseP  88.64 
 
 		 347 bp  48.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0051  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 297 bp  48.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0146  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 298 bp  48.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0972194  hitchhiker  0.00000000182865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0013  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 306 bp  48.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.321462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0031  RNA component of RNaseP  88.64 
 
 		 347 bp  48.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0022  RNaseP RNA  88.64 
 
 		 347 bp  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00017502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0023  RNA component of RNaseP  88.64 
 
 		 304 bp  48.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000192247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0006  RNA component of RNaseP  88.64 
 
 		 347 bp  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0741238  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0073  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 299 bp  48.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0014  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 331 bp  48.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000221757  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  88.37 
 
 		 332 bp  46.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0024  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 298 bp  46.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  96.3 
 
 		 296 bp  46.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  89.74 
 
 		 308 bp  46.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    96.3 
 
 		 295 bp  46.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 295 bp  46.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 295 bp  46.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0006  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 305 bp  46.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0010  RNA component of RNaseP  88.37 
 
 		 312 bp  46.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0227621  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpls01    96.3 
 
 		 205 bp  46.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpps01    96.3 
 
 		 205 bp  46.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>