62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_R0067 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_R0067  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 382 bp  757    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0337579  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  88.42 
 
 		 332 bp  101  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  89.02 
 
 		 302 bp  91.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0002  RNA component of RNaseP  93.33 
 
 		 237 bp  87.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0585787 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  87.8 
 
 		 298 bp  83.8  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0031  RNA component of RNaseP  88.57 
 
 		 346 bp  75.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4342  RNA component of RNase P  87.67 
 
 		 353 bp  73.8  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0051  RNA component of RNaseP  84.96 
 
 		 295 bp  73.8  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.90798  normal  0.258556 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0059  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 251 bp  71.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0054  rnpB RNA  86.84 
 
 		 298 bp  71.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0029  RNA component of RNaseP  87.14 
 
 		 298 bp  67.9  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.538332  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0019    87.14 
 
 		 348 bp  67.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0920457  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  85.9 
 
 		 305 bp  67.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0216  sRNA  85.71 
 
 		 346 bp  65.9  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0217  Bacterial RNase P class A  85.53 
 
 		 294 bp  63.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0127  RNA component of RNaseP  84.09 
 
 		 304 bp  63.9  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0003  RNA component of RNaseP  85.53 
 
 		 294 bp  63.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158613 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0010  RNA component of RNaseP  84.09 
 
 		 312 bp  63.9  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0227621  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0025  RNA component of RNaseP  93.02 
 
 		 368 bp  61.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0016  RNA component of RNaseP  84.34 
 
 		 329 bp  61.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0093  RNA component of RNaseP  86.49 
 
 		 303 bp  60  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963867  normal  0.310473 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0014  RNA component of RNaseP  86.49 
 
 		 303 bp  60  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 294 bp  56  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4435  Bacterial RNase P class A  96.88 
 
 		 301 bp  56  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0846372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0083  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 301 bp  56  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481467  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0013  RNA component of RNaseP  86.11 
 
 		 296 bp  56  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.297268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4977  Bacterial RNase P class A  96.88 
 
 		 301 bp  56  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0012  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 301 bp  56  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4220  bacterial RNase P, class A  96.88 
 
 		 303 bp  56  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0014    96.88 
 
 		 301 bp  56  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0073  RNA component of RNaseP  82.95 
 
 		 299 bp  56  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  94.44 
 
 		 359 bp  56  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4302  RNase P class A  96.88 
 
 		 303 bp  56  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0032  RNA component of RNaseP  84.72 
 
 		 233 bp  56  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4778  RNase P, class A  96.88 
 
 		 301 bp  56  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3605  Bacterial RNase P class A  96.77 
 
 		 301 bp  54  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.976853 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0076  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 303 bp  54  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09520  Bacterial RNase P class A  96.77 
 
 		 325 bp  54  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0013  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 303 bp  54  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3436  Bacterial RNase P class A  96.77 
 
 		 301 bp  54  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3439  Bacterial RNase P class A  96.77 
 
 		 301 bp  54  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3544  Bacterial RNase P class A  96.77 
 
 		 301 bp  54  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3508  Bacterial RNase P class A  96.77 
 
 		 301 bp  54  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0053  RNA component of RNaseP  82.22 
 
 		 347 bp  52  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    96.67 
 
 		 330 bp  52  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0010  RNA component of RNaseP  82.22 
 
 		 302 bp  52  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0305173  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0015  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 313 bp  48.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0681345  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0043  RNA component of RNaseP  82.89 
 
 		 312 bp  48.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.282999  hitchhiker  0.0000000823282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0070  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 357 bp  48.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0014  RNA component of RNaseP  81.82 
 
 		 331 bp  48.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000221757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0033  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 391 bp  48.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.408233  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_DernpB1  sRNA  93.75 
 
 		 261 bp  48.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.573184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0001  RNaseP RNA  96.88 
 
 		 361 bp  48.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0025  RNA component of RNaseP  81.82 
 
 		 298 bp  48.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0126    81.82 
 
 		 298 bp  48.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0006  RNAse P  93.75 
 
 		 304 bp  48.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.161973  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0010  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 317 bp  48.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0451963  hitchhiker  0.000582152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0134  RNA component of RNaseP  81.82 
 
 		 298 bp  48.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0020    93.75 
 
 		 296 bp  48.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0020    93.75 
 
 		 296 bp  48.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00893  RNA component of RNase P  93.75 
 
 		 308 bp  48.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08950  Bacterial RNase P class A  100 
 
 		 306 bp  46.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>