195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_R0030 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 369 bp  731    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  90.24 
 
 		 354 bp  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 352 bp  391  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    88.89 
 
 		 352 bp  391  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  90.27 
 
 		 318 bp  383  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  85.5 
 
 		 339 bp  141  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  93.41 
 
 		 356 bp  133  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  93.41 
 
 		 353 bp  133  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  85.8 
 
 		 348 bp  129  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  83.73 
 
 		 345 bp  115  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  90.91 
 
 		 340 bp  111  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  83.05 
 
 		 328 bp  109  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  89.77 
 
 		 427 bp  103  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 326 bp  99.6  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  87.91 
 
 		 332 bp  93.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  89.02 
 
 		 309 bp  91.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0068  RNA component of RNaseP  88.37 
 
 		 338 bp  91.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.400378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  87.5 
 
 		 348 bp  87.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  87.5 
 
 		 316 bp  87.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  86.36 
 
 		 328 bp  79.8  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0017  RNA component of RNaseP  86.36 
 
 		 307 bp  79.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316864  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0034  RNA component of RNaseP  85.56 
 
 		 339 bp  75.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0045  RNA component of RNaseP  85.88 
 
 		 312 bp  73.8  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 303 bp  73.8  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0031  RNA component of RNaseP  85.23 
 
 		 347 bp  71.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0023    85.23 
 
 		 347 bp  71.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0006  RNA component of RNaseP  85.23 
 
 		 347 bp  71.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0741238  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0023    85.23 
 
 		 347 bp  71.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000569795  normal  0.573618 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    100 
 
 		 303 bp  71.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0023  RNA component of RNaseP  85.23 
 
 		 304 bp  71.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000192247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0022  RNaseP RNA  85.23 
 
 		 347 bp  71.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00017502  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0009    85.23 
 
 		 350 bp  71.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000711209  normal  0.574363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0038  RNA component of RNaseP  85.23 
 
 		 354 bp  71.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0631532  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0063  RNA component of RNaseP  85.23 
 
 		 347 bp  71.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08950  Bacterial RNase P class A  88.57 
 
 		 306 bp  69.9  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0972  sRNA  100 
 
 		 292 bp  67.9  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0035  RNA component of RNaseP  97.37 
 
 		 310 bp  67.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0052  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 355 bp  67.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0014  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 342 bp  67.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0021  RNA component of RNaseP  97.37 
 
 		 359 bp  67.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0056  RNA component of RNaseP  97.37 
 
 		 335 bp  67.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.425167 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  100 
 
 		 302 bp  67.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 305 bp  67.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    87.8 
 
 		 295 bp  67.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  100 
 
 		 359 bp  65.9  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0003  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5661  RNaseP_bact_a  100 
 
 		 293 bp  65.9  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00231772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA62  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 292 bp  65.9  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0216  sRNA  100 
 
 		 346 bp  65.9  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0049  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 386 bp  65.9  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.653302  normal  0.250597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0005  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 381 bp  65.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.328274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R74  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 291 bp  65.9  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    100 
 
 		 295 bp  65.9  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0022  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 369 bp  65.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00496302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0048  RNA component of RNaseP  83.87 
 
 		 333 bp  65.9  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.231595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0068  RNA component of RNaseP  91.84 
 
 		 350 bp  65.9  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000826287  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  100 
 
 		 296 bp  65.9  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0035  RNA component of RNaseP  84.71 
 
 		 334 bp  65.9  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 295 bp  65.9  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0039  RNA component of RNaseP  89.47 
 
 		 341 bp  65.9  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0961177  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0041  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 329 bp  65.9  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0217  Bacterial RNase P class A  100 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  100 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 295 bp  65.9  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  86.9 
 
 		 398 bp  63.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0059  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 374 bp  63.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0028  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 366 bp  63.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0061  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 418 bp  63.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0246154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0035  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 326 bp  63.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  84.09 
 
 		 326 bp  63.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA10  RNaseP  100 
 
 		 365 bp  63.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0052  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 326 bp  63.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0024  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 298 bp  63.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0010  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 317 bp  61.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0451963  hitchhiker  0.000582152 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0012  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 301 bp  60  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpps01    97.06 
 
 		 205 bp  60  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpls01    97.06 
 
 		 205 bp  60  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0025  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 332 bp  60  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0035  RNA component of RNaseP  84.62 
 
 		 284 bp  60  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0003  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 330 bp  60  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0285718 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0036  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 312 bp  60  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.792422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0013  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0046  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 326 bp  60  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.770648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0014    97.06 
 
 		 301 bp  60  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0014  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 298 bp  60  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0063  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 305 bp  60  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0344587 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3508  Bacterial RNase P class A  97.06 
 
 		 301 bp  60  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0083  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 301 bp  60  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481467  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4977  Bacterial RNase P class A  97.06 
 
 		 301 bp  60  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0076  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3439  Bacterial RNase P class A  97.06 
 
 		 301 bp  60  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0055  RNase P  100 
 
 		 338 bp  60  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4220  bacterial RNase P, class A  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3605  Bacterial RNase P class A  97.06 
 
 		 301 bp  60  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.976853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4302  RNase P class A  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00893  RNA component of RNase P  97.06 
 
 		 308 bp  60  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4778  RNase P, class A  97.06 
 
 		 301 bp  60  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0146  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 298 bp  60  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0972194  hitchhiker  0.00000000182865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0093  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 303 bp  60  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963867  normal  0.310473 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>