168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0035 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0035  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 284 bp  563  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 328 bp  107  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0034  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 339 bp  107  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  91.03 
 
 		 332 bp  99.6  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  91.03 
 
 		 326 bp  99.6  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0048  RNA component of RNaseP  89.89 
 
 		 333 bp  97.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.231595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  88.46 
 
 		 340 bp  83.8  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  88.16 
 
 		 339 bp  79.8  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0038  RNA component of RNaseP  88.16 
 
 		 354 bp  79.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0631532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  87.18 
 
 		 309 bp  75.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  87.18 
 
 		 356 bp  75.8  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  87.18 
 
 		 353 bp  75.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0025  RNA component of RNaseP  90.16 
 
 		 184 bp  73.8  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0055  RNase P  100 
 
 		 338 bp  73.8  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0035  RNA component of RNaseP  91.07 
 
 		 334 bp  71.9  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0036  rnpB RNA  86.84 
 
 		 337 bp  71.9  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407742  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  86.84 
 
 		 316 bp  71.9  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  86.84 
 
 		 348 bp  71.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0051  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 295 bp  67.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.90798  normal  0.258556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5661  RNaseP_bact_a  97.3 
 
 		 293 bp  65.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00231772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA62  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 292 bp  65.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R74  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 291 bp  65.9  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  97.3 
 
 		 296 bp  65.9  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0217  Bacterial RNase P class A  97.3 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235788  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0216  sRNA  97.3 
 
 		 346 bp  65.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  97.3 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 295 bp  65.9  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 295 bp  65.9  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    97.3 
 
 		 295 bp  65.9  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0003  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 294 bp  65.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  85.53 
 
 		 328 bp  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0014  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 342 bp  63.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  85.53 
 
 		 427 bp  63.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0127  RNA component of RNaseP  95 
 
 		 304 bp  63.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  100 
 
 		 359 bp  61.9  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0049  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 386 bp  61.9  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.653302  normal  0.250597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0022  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 369 bp  61.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00496302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0972  sRNA  100 
 
 		 292 bp  61.9  0.00000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0028  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 366 bp  61.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0061  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 418 bp  61.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0246154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0052  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 355 bp  61.9  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  100 
 
 		 302 bp  61.9  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0059  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 374 bp  61.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 305 bp  61.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_miscRNA10  RNaseP  100 
 
 		 365 bp  61.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0004  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 396 bp  61.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  87.95 
 
 		 328 bp  61.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0030  RNA component of RNaseP  94.87 
 
 		 322 bp  61.9  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0025  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 332 bp  60  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    100 
 
 		 303 bp  60  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0024  RNA component of RNase P  94.74 
 
 		 349 bp  60  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.699982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0052  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 120 bp  60  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0048  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 326 bp  60  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.584671  normal  0.777963 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0053  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 347 bp  60  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  84.62 
 
 		 369 bp  60  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0013  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 296 bp  60  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.297268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rnpBVIMSS1309406  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  97.06 
 
 		 333 bp  60  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3565  RNase P class A  97.06 
 
 		 350 bp  60  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  84.62 
 
 		 354 bp  60  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 326 bp  60  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0053  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 347 bp  60  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0051  RNA component of RNaseP  94.59 
 
 		 297 bp  58  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0003  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 330 bp  58  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0285718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0073  RNA component of RNaseP  94.59 
 
 		 299 bp  58  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 294 bp  58  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0014  RNaseP RNA  94.59 
 
 		 296 bp  58  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384049  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0063  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 305 bp  58  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0344587 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rnpBVIMSS1309424  RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  96.97 
 
 		 398 bp  58  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15110  Bacterial RNase P class A  89.8 
 
 		 324 bp  58  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rnpBVIMSS1309440  rnpB RnpB RNA: catalytic subunit of RNase P  96.97 
 
 		 390 bp  58  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  84.21 
 
 		 348 bp  56  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  84.21 
 
 		 345 bp  56  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00893  RNA component of RNase P  96.88 
 
 		 308 bp  56  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0013  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 291 bp  56  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpps01    96.77 
 
 		 205 bp  54  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpls01    96.77 
 
 		 205 bp  54  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0020    96.77 
 
 		 296 bp  54  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0055  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 354 bp  54  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264132  normal  0.793704 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0031  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 347 bp  54  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0006  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 305 bp  54  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0068  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 350 bp  54  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000826287  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0014  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 331 bp  54  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000221757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0025  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 298 bp  54  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3544  Bacterial RNase P class A  96.77 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0137  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 300 bp  54  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0019  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 300 bp  54  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0017  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 300 bp  54  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.585767  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0023  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 304 bp  54  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000192247  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3436  Bacterial RNase P class A  96.77 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0022  RNaseP RNA  96.77 
 
 		 347 bp  54  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00017502  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0137  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 300 bp  54  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4435  Bacterial RNase P class A  96.77 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0846372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0126    96.77 
 
 		 298 bp  54  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0146  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 299 bp  54  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0063  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 347 bp  54  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4220  bacterial RNase P, class A  96.77 
 
 		 303 bp  54  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0014    96.77 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0023    96.77 
 
 		 347 bp  54  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000610134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3605  Bacterial RNase P class A  96.77 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.976853 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0020    96.77 
 
 		 296 bp  54  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>