97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_R0035 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_R0035  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 334 bp  662    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  87.8 
 
 		 316 bp  299  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15110  Bacterial RNase P class A  86.81 
 
 		 324 bp  250  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0068  RNA component of RNaseP  86.54 
 
 		 338 bp  218  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.400378  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0039  RNA component of RNaseP  88.35 
 
 		 341 bp  214  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0961177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0038  RNA component of RNaseP  86.87 
 
 		 354 bp  174  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0631532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  85.15 
 
 		 348 bp  159  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0034  RNA component of RNaseP  84.34 
 
 		 339 bp  147  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0025  RNA component of RNaseP  86.59 
 
 		 184 bp  145  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  85.07 
 
 		 345 bp  141  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0048  RNA component of RNaseP  82.83 
 
 		 333 bp  135  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.231595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  83.74 
 
 		 309 bp  131  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0036  rnpB RNA  83.84 
 
 		 337 bp  131  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407742  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  83.33 
 
 		 348 bp  131  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  92.47 
 
 		 340 bp  129  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  82.91 
 
 		 332 bp  125  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  82.59 
 
 		 353 bp  117  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  82.09 
 
 		 356 bp  117  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  90.91 
 
 		 339 bp  111  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12130  Bacterial RNase P class A  85 
 
 		 317 bp  111  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0161879  normal  0.0949657 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0045  RNA component of RNaseP  90.22 
 
 		 312 bp  111  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  81.82 
 
 		 328 bp  109  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  83.42 
 
 		 328 bp  107  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  81 
 
 		 427 bp  107  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16640  Bacterial RNase P class A  89.77 
 
 		 299 bp  103  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0340654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 326 bp  99.6  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    87.06 
 
 		 352 bp  81.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  87.06 
 
 		 352 bp  81.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  87.06 
 
 		 318 bp  81.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09520  Bacterial RNase P class A  86.9 
 
 		 325 bp  79.8  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546213  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  85.88 
 
 		 354 bp  73.8  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0035  RNA component of RNaseP  91.07 
 
 		 284 bp  71.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  95.12 
 
 		 328 bp  65.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  84.71 
 
 		 369 bp  65.9  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    85.39 
 
 		 303 bp  65.9  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0034  RNA component of RNaseP  95.12 
 
 		 306 bp  65.9  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0051  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 345 bp  60  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384072  normal  0.735401 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0026  RNA component of RNaseP  94.74 
 
 		 326 bp  60  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0053  RNA component of RNaseP  92.68 
 
 		 347 bp  58  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  92.68 
 
 		 294 bp  58  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0081  RNA component of RNaseP  91.11 
 
 		 327 bp  58  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000487507  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  83.95 
 
 		 326 bp  58  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  91.11 
 
 		 323 bp  58  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0053  RNA component of RNaseP  92.68 
 
 		 347 bp  58  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  84.21 
 
 		 303 bp  56  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    100 
 
 		 358 bp  56  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4342  RNA component of RNase P  87.27 
 
 		 353 bp  54  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 398 bp  54  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0019    87.27 
 
 		 348 bp  54  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0920457  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 305 bp  52  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  83.33 
 
 		 315 bp  52  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1382  Bacterial RNase P class A  94.12 
 
 		 312 bp  52  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0059  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 343 bp  52  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0109691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    96.67 
 
 		 330 bp  52  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0053  RNase P  83.33 
 
 		 326 bp  52  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0013  RNA_RNaseP_classA  94.12 
 
 		 313 bp  52  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.336548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0003  RNA component of RNaseP  83.33 
 
 		 315 bp  52  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  100 
 
 		 302 bp  52  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 308 bp  50.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0023    96.43 
 
 		 341 bp  48.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0216677 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  82.95 
 
 		 373 bp  48.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0029  RNA component of RNaseP  85 
 
 		 364 bp  48.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.830354  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0029  RNA component of RNaseP  82.89 
 
 		 298 bp  48.1  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.538332  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0071  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 352 bp  48.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671798 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0031  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 346 bp  48.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0015  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 313 bp  48.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0681345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  100 
 
 		 801 bp  48.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  91.67 
 
 		 301 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0063  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 359 bp  48.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0076  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 352 bp  48.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0055  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 354 bp  48.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264132  normal  0.793704 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 332 bp  48.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0073  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 299 bp  46.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4220  bacterial RNase P, class A  93.55 
 
 		 303 bp  46.1  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0043    91.43 
 
 		 293 bp  46.1  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00678643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  96.3 
 
 		 294 bp  46.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0033  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 304 bp  46.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256591  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0003  RNase P  85.45 
 
 		 331 bp  46.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 295 bp  46.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0051  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 297 bp  46.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0012  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4302  RNase P class A  93.55 
 
 		 303 bp  46.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4778  RNase P, class A  93.55 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0093  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 303 bp  46.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.963867  normal  0.310473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3508  Bacterial RNase P class A  93.55 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 295 bp  46.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0014    93.55 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0014  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 303 bp  46.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0083  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.481467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    96.3 
 
 		 295 bp  46.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  96.3 
 
 		 296 bp  46.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4977  Bacterial RNase P class A  93.55 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4435  Bacterial RNase P class A  93.55 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0846372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3605  Bacterial RNase P class A  93.55 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.976853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3436  Bacterial RNase P class A  93.55 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3439  Bacterial RNase P class A  93.55 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3544  Bacterial RNase P class A  93.55 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.285597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>