67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16640 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16640  Bacterial RNase P class A  100 
 
 		 299 bp  593  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0340654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0034  RNA component of RNaseP  84.38 
 
 		 339 bp  119  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09520  Bacterial RNase P class A  85.35 
 
 		 325 bp  113  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546213  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0039  RNA component of RNaseP  82.59 
 
 		 341 bp  105  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0961177  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0035  RNA component of RNaseP  89.77 
 
 		 334 bp  103  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  88.76 
 
 		 348 bp  97.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0048  RNA component of RNaseP  88.64 
 
 		 333 bp  95.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.231595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15110  Bacterial RNase P class A  93.65 
 
 		 324 bp  93.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  84.4 
 
 		 348 bp  89.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  87.64 
 
 		 309 bp  89.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12130  Bacterial RNase P class A  79.5 
 
 		 317 bp  89.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0161879  normal  0.0949657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0036  rnpB RNA  84.72 
 
 		 337 bp  89.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  82.11 
 
 		 345 bp  83.8  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0038  RNA component of RNaseP  86.52 
 
 		 354 bp  81.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0631532  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0063  RNA component of RNaseP  83.97 
 
 		 359 bp  81.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  86.36 
 
 		 316 bp  79.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  81.56 
 
 		 326 bp  79.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0025  RNA component of RNaseP  89.71 
 
 		 184 bp  79.8  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0034  RNA component of RNaseP  86.84 
 
 		 333 bp  71.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0634985 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0068  RNA component of RNaseP  85.87 
 
 		 338 bp  71.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.400378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  85.23 
 
 		 339 bp  71.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0085  RNA component of RNaseP  85.19 
 
 		 358 bp  65.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162846  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0023    81.25 
 
 		 341 bp  65.9  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0216677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  84.27 
 
 		 328 bp  65.9  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  84.09 
 
 		 332 bp  63.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0017  RNA component of RNaseP  85 
 
 		 332 bp  63.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312757  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0064  RNA component of RNaseP  85.53 
 
 		 316 bp  63.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0444698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  84.09 
 
 		 328 bp  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  81.56 
 
 		 340 bp  63.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0071  RNA component of RNaseP  85.33 
 
 		 352 bp  61.9  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0076  RNA component of RNaseP  85.33 
 
 		 352 bp  61.9  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0074    85.33 
 
 		 352 bp  61.9  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.301827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0020    85.19 
 
 		 296 bp  58  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 427 bp  58  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0081  RNA component of RNaseP  91.11 
 
 		 327 bp  58  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000487507  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  83.15 
 
 		 356 bp  58  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0020    85.19 
 
 		 296 bp  58  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  83.15 
 
 		 353 bp  58  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0013  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 296 bp  56  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.297268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0045  RNA component of RNaseP  82.95 
 
 		 312 bp  56  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0043    100 
 
 		 293 bp  54  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00678643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0030  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 322 bp  54  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0070  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 357 bp  52  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  92.11 
 
 		 328 bp  52  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4508  RNase P RNA component precursor RnpB  85.71 
 
 		 396 bp  50.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 323 bp  50.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 294 bp  50.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0002  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 346 bp  50.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.269548 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0034  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 306 bp  50.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0039    82.35 
 
 		 363 bp  50.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0051  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 345 bp  50.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384072  normal  0.735401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0035  RNaseP RNA  96.43 
 
 		 378 bp  48.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_rnpB  RNase P RNA component  82.14 
 
 		 326 bp  48.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0024  RNA component of RNase P  83.52 
 
 		 349 bp  48.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.699982  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_R0055    96.43 
 
 		 320 bp  48.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  87.5 
 
 		 301 bp  48.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1398  sRNA  93.75 
 
 		 422 bp  48.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0003  RNase P  96.43 
 
 		 331 bp  48.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0029  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 364 bp  48.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.830354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  81.82 
 
 		 315 bp  48.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0055  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 354 bp  48.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264132  normal  0.793704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    93.55 
 
 		 352 bp  46.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 352 bp  46.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0032  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 333 bp  46.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.148898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 318 bp  46.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0056  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 335 bp  46.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.425167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0034  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 333 bp  46.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0944967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>