75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15110 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15110  Bacterial RNase P class A  100 
 
 		 324 bp  642    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0035  RNA component of RNaseP  86.81 
 
 		 334 bp  250  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0045  RNA component of RNaseP  90.36 
 
 		 312 bp  224  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12130  Bacterial RNase P class A  86.12 
 
 		 317 bp  208  7e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0161879  normal  0.0949657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  83.97 
 
 		 316 bp  186  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0039  RNA component of RNaseP  85.71 
 
 		 341 bp  184  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0961177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0038  RNA component of RNaseP  87.37 
 
 		 354 bp  174  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0631532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  86.84 
 
 		 348 bp  168  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0048  RNA component of RNaseP  85.86 
 
 		 333 bp  167  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.231595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  85.11 
 
 		 353 bp  147  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0068  RNA component of RNaseP  81.54 
 
 		 338 bp  145  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.400378  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  84.46 
 
 		 309 bp  145  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  84.57 
 
 		 345 bp  143  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  84.21 
 
 		 348 bp  139  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  85.26 
 
 		 339 bp  133  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  84.66 
 
 		 356 bp  133  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0034  RNA component of RNaseP  83.25 
 
 		 339 bp  125  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  86.11 
 
 		 328 bp  121  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  83.25 
 
 		 332 bp  121  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  83.42 
 
 		 340 bp  115  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0036  rnpB RNA  90.91 
 
 		 337 bp  111  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407742  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0025  RNA component of RNaseP  83.63 
 
 		 184 bp  111  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  83.85 
 
 		 326 bp  111  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  89.89 
 
 		 427 bp  105  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16640  Bacterial RNase P class A  93.65 
 
 		 299 bp  93.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0340654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09520  Bacterial RNase P class A  82.02 
 
 		 325 bp  85.7  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  82.42 
 
 		 328 bp  83.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    86.59 
 
 		 352 bp  75.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  86.59 
 
 		 352 bp  75.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  86.59 
 
 		 318 bp  75.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0034  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 306 bp  69.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  95.24 
 
 		 328 bp  67.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0051  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 345 bp  67.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384072  normal  0.735401 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0026  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 326 bp  61.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  84.34 
 
 		 354 bp  61.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0059  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 343 bp  60  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0109691  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0053  RNA component of RNaseP  92.86 
 
 		 347 bp  60  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  92.86 
 
 		 294 bp  60  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0053  RNA component of RNaseP  92.86 
 
 		 347 bp  60  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    86.42 
 
 		 303 bp  58  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0013  RNA_RNaseP_classA  96.97 
 
 		 313 bp  58  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.336548  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1382  Bacterial RNase P class A  96.97 
 
 		 312 bp  58  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0035  RNA component of RNaseP  89.8 
 
 		 284 bp  58  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    86.42 
 
 		 358 bp  58  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  82.95 
 
 		 369 bp  56  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  94.44 
 
 		 308 bp  56  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0033  RNA component of RNaseP  94.44 
 
 		 304 bp  56  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256591  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4342  RNA component of RNase P  87.27 
 
 		 353 bp  54  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  94.29 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 373 bp  54  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0019    87.27 
 
 		 348 bp  54  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0920457  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0043    94.29 
 
 		 293 bp  54  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00678643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0035  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 363 bp  54  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.531572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  83.33 
 
 		 315 bp  52  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    85.37 
 
 		 295 bp  52  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0037  RNaseP RNA  94.12 
 
 		 347 bp  52  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0063  RNA component of RNaseP  90.48 
 
 		 359 bp  52  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0003  RNase P  83.15 
 
 		 331 bp  50.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0081  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 327 bp  50.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000487507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 323 bp  50.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0052  RNA component of RNaseP  85.29 
 
 		 120 bp  48.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0068  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 372 bp  48.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.415959  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 332 bp  48.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  82.89 
 
 		 303 bp  48.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2169  RNA component of RNase P  90 
 
 		 275 bp  48.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0071  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 352 bp  48.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0076  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 352 bp  48.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0055  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 354 bp  48.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264132  normal  0.793704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0023    96.43 
 
 		 341 bp  48.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0216677 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0020  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 336 bp  46.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00784007  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  96.3 
 
 		 302 bp  46.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0031  RNA component of RNaseP  85.45 
 
 		 346 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0029  RNA component of RNaseP  85.45 
 
 		 364 bp  46.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.830354  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0007    91.43 
 
 		 344 bp  46.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.877668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>