27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_R0037 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_R0037  RNaseP RNA  100 
 
 		 347 bp  688    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0059  RNA component of RNaseP  84.9 
 
 		 343 bp  250  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0109691  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0051  RNA component of RNaseP  86.26 
 
 		 345 bp  117  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384072  normal  0.735401 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0026  RNA component of RNaseP  84.73 
 
 		 326 bp  93.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0025  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 184 bp  60  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0036  rnpB RNA  97.06 
 
 		 337 bp  60  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407742  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1382  Bacterial RNase P class A  96.88 
 
 		 312 bp  56  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0013  RNA_RNaseP_classA  96.88 
 
 		 313 bp  56  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.336548  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0034  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 306 bp  54  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09520  Bacterial RNase P class A  94.12 
 
 		 325 bp  52  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546213  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 326 bp  52  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0034  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 339 bp  52  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0048  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 333 bp  52  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.231595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15110  Bacterial RNase P class A  94.12 
 
 		 324 bp  52  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0045  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 312 bp  52  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  94.12 
 
 		 340 bp  52  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 345 bp  52  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 328 bp  52  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0068  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 338 bp  52  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.400378  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0017  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 307 bp  48.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316864  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    93.75 
 
 		 295 bp  48.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0097  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 346 bp  48.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12130  Bacterial RNase P class A  93.55 
 
 		 317 bp  46.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0161879  normal  0.0949657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 398 bp  46.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 348 bp  46.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0043  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 213 bp  46.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000487494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0038  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 354 bp  46.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0631532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>