71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_R0025 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_R0025  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 184 bp  365  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0036  rnpB RNA  89.13 
 
 		 337 bp  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407742  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  84.78 
 
 		 328 bp  157  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  86.74 
 
 		 309 bp  153  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0035  RNA component of RNaseP  86.59 
 
 		 334 bp  145  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  85.87 
 
 		 348 bp  145  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  84.44 
 
 		 348 bp  139  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  83.78 
 
 		 332 bp  133  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0048  RNA component of RNaseP  83.7 
 
 		 333 bp  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.231595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0027  RNA component of RNaseP  83.52 
 
 		 326 bp  129  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0038  RNA component of RNaseP  84.44 
 
 		 354 bp  127  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0631532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0022  RNA component of RNaseP  84.78 
 
 		 345 bp  127  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07210  bacterial RNase P class A  83.15 
 
 		 340 bp  125  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0039  RNA component of RNaseP  84.27 
 
 		 341 bp  121  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0961177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  92.05 
 
 		 328 bp  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  83.62 
 
 		 316 bp  115  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0034  RNA component of RNaseP  82.61 
 
 		 339 bp  115  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15110  Bacterial RNase P class A  83.63 
 
 		 324 bp  111  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  82.61 
 
 		 356 bp  109  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  89.89 
 
 		 353 bp  105  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0068  RNA component of RNaseP  89.02 
 
 		 338 bp  91.7  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.400378  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12130  Bacterial RNase P class A  88.89 
 
 		 317 bp  89.7  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0161879  normal  0.0949657 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0045  RNA component of RNaseP  90.14 
 
 		 312 bp  85.7  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    86.67 
 
 		 352 bp  83.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  86.67 
 
 		 352 bp  83.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  86.67 
 
 		 318 bp  83.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16640  Bacterial RNase P class A  89.71 
 
 		 299 bp  79.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0340654  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09520  Bacterial RNase P class A  86.9 
 
 		 325 bp  79.8  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.546213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0031  RNA component of RNaseP  88.73 
 
 		 339 bp  77.8  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113623  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  90.16 
 
 		 303 bp  73.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0035  RNA component of RNaseP  90.16 
 
 		 284 bp  73.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_r0013  RNA_RNaseP_classA  100 
 
 		 313 bp  65.9  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.336548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0046  RNA component of RNaseP  93.33 
 
 		 427 bp  65.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0219533  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1382  Bacterial RNase P class A  100 
 
 		 312 bp  65.9  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0026  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 326 bp  61.9  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0034  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 306 bp  61.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0037  RNaseP RNA  97.06 
 
 		 347 bp  60  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0051  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 345 bp  60  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000384072  normal  0.735401 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0059  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 343 bp  60  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0109691  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0053  RNA component of RNaseP  92.86 
 
 		 347 bp  60  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  92.86 
 
 		 328 bp  60  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    87.93 
 
 		 303 bp  60  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0053  RNA component of RNaseP  92.86 
 
 		 347 bp  60  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2169  RNA component of RNase P  92.68 
 
 		 275 bp  58  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  82.95 
 
 		 354 bp  56  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  82.95 
 
 		 369 bp  56  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0055  RNase P  90.24 
 
 		 338 bp  50.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  82.72 
 
 		 373 bp  50.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0070  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 357 bp  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0043    91.89 
 
 		 293 bp  50.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00678643  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0038  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 294 bp  50.1  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0147775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0097  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 346 bp  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0019  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 297 bp  48.1  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000680683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0003  RNase P  90 
 
 		 331 bp  48.1  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    96.43 
 
 		 295 bp  48.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  91.67 
 
 		 308 bp  48.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0056  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 335 bp  48.1  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.425167 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0030  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 353 bp  48.1  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  100 
 
 		 302 bp  48.1  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0055  RNA component of RNaseP  96.43 
 
 		 354 bp  48.1  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264132  normal  0.793704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0074    90 
 
 		 352 bp  48.1  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.301827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0033  RNA component of RNaseP  91.43 
 
 		 304 bp  46.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256591  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_rnpB  RNase P RNA component  91.43 
 
 		 326 bp  46.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4342  RNA component of RNase P  85.45 
 
 		 353 bp  46.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0068  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 372 bp  46.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.415959  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  91.43 
 
 		 301 bp  46.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0019    85.45 
 
 		 348 bp  46.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0920457  normal  0.986238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0034  RNA component of RNaseP  89.74 
 
 		 333 bp  46.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0634985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0043  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 213 bp  46.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000487494  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    84.75 
 
 		 358 bp  46.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  84.75 
 
 		 315 bp  46.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>