22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_R0030 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_R0030  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 353 bp  700    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_CjrnpB1  sRNA  89.25 
 
 		 318 bp  105  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2169  RNA component of RNase P  85.42 
 
 		 275 bp  79.8  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0761  RNA component of Rnase P  90.91 
 
 		 319 bp  69.9  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.545949  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2244  bacterial RNase P, class A  83.33 
 
 		 274 bp  63.9  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0540535  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 308 bp  52  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 353 bp  52  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 356 bp  52  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0033  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 304 bp  50.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256591  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 373 bp  50.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  96.55 
 
 		 301 bp  50.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1797  bacterial RNase P, class A  83.75 
 
 		 380 bp  48.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.848087  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0025  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 184 bp  48.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0005  RNase P class A  93.55 
 
 		 280 bp  46.1  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0017  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 332 bp  46.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312757  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0036  rnpB RNA  93.55 
 
 		 337 bp  46.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407742  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_R0055    96.3 
 
 		 320 bp  46.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0005  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 280 bp  46.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.500328  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0009  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 348 bp  46.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4342  RNA component of RNase P  96.3 
 
 		 353 bp  46.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0033  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 391 bp  46.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.408233  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_rnpB  RNase P RNA component  96.3 
 
 		 326 bp  46.1  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>