30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1797 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1797  bacterial RNase P, class A  100 
 
 		 380 bp  753    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.848087  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2169  RNA component of RNase P  84.81 
 
 		 275 bp  61.9  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 332 bp  60  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 328 bp  60  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    100 
 
 		 330 bp  58  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 323 bp  58  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2244  bacterial RNase P, class A  83.54 
 
 		 274 bp  54  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0540535  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0019  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 297 bp  54  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000680683  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0034  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 284 bp  50.1  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0028  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 270 bp  50.1  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0043    100 
 
 		 293 bp  50.1  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00678643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0068  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 372 bp  50.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.415959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    96.55 
 
 		 295 bp  50.1  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0056  RNase P class A  96.55 
 
 		 276 bp  50.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.441573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0761  RNA component of Rnase P  83.75 
 
 		 319 bp  48.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.545949  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0030  RNA component of RNaseP  83.75 
 
 		 353 bp  48.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0033  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 272 bp  46.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0012  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 356 bp  46.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0591334 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0736  Bacterial RNase P class A  96.3 
 
 		 288 bp  46.1  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0012  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 357 bp  46.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0003  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 315 bp  46.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 353 bp  46.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  96.3 
 
 		 315 bp  46.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0053  RNase P  96.3 
 
 		 326 bp  46.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 356 bp  46.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    93.55 
 
 		 352 bp  46.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 352 bp  46.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 318 bp  46.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0003  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 327 bp  46.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0016  RNA component of RNaseP  96.3 
 
 		 329 bp  46.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>